Determinación de la efectividad de cinco protocolos de extracción de ADN a partir de material parafinado para estudios moleculares
El estudio evaluó cuatro distintos protocolos de uso común en laboratorio y uno comercial, para la extracción de ADN a partir de material fijado en formalina y parafinado, correspondiente a cervix uterinos producto de conizaciones y LEEPs (loop electrocautery excision procedure), provenientes de los...
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Universidad de Costa Rica
2007
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MEDICA78692015-11-26T19:22:31Z Determinación de la efectividad de cinco protocolos de extracción de ADN a partir de material parafinado para estudios moleculares Jiménez Arce, Gerardo Villalobos Quesada, María José Jiménez Montero, Ernesto Palma Platero, Walter Patología molecular PCR ADN formalina parafinado CCSS molecular pathology DNA formalin-fixed paraffined El estudio evaluó cuatro distintos protocolos de uso común en laboratorio y uno comercial, para la extracción de ADN a partir de material fijado en formalina y parafinado, correspondiente a cervix uterinos producto de conizaciones y LEEPs (loop electrocautery excision procedure), provenientes de los Servicios de Patología de nueve Hospitales de la Caja Costarricense de Seguro Social (CCSS). Se encontró que el protocolo más efectivo para obtener ADN viable para la PCR, es el basado en extracción fenólica y que la calidad del ADN se ve profundamente afectada por el proceso de preservación al que se ven sometidos los tejidos en los diferentes servicios. El promedio general de amplificación estuvo por debajo del 50%. El rango de amplificación por servicio va desde el 0%, hasta el 70%. Las razones por las que la PCR a partir de ADN aislado de parafinadas resulta inconsistente, se pueden resumir, a grosso modo, en: baja cantidad o ausencia de ADN blanco detectable, presencia de inhibidores, degradación del ADN total blanco y fragmentación de los ácidos nucleicos debido a la fijación en formalina. Universidad de Costa Rica 2007-06-01 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion Article Text application/pdf https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/medica/article/view/7869 10.15517/rmu.v1i1.7869 Revista Médica de la Universidad de Costa Rica; Vol. 1 No. 1 (2007): Revista Médica de la Universidad de Costa Rica : Volumen 1, Número 1; 10-19 Revista Médica de la Universidad de Costa Rica; Vol. 1 Núm. 1 (2007): Revista Médica de la Universidad de Costa Rica : Volumen 1, Número 1; 10-19 1659-2441 spa https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/medica/article/view/7869/7513 Derechos de autor 2014 Revista Médica de la Universidad de Costa Rica |
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El estudio evaluó cuatro distintos protocolos de uso común en laboratorio y uno comercial, para la extracción de ADN a partir de material fijado en formalina y parafinado, correspondiente a cervix uterinos producto de conizaciones y LEEPs (loop electrocautery excision procedure), provenientes de los Servicios de Patología de nueve Hospitales de la Caja Costarricense de Seguro Social (CCSS). Se encontró que el protocolo más efectivo para obtener ADN viable para la PCR, es el basado en extracción fenólica y que la calidad del ADN se ve profundamente afectada por el proceso de preservación al que se ven sometidos los tejidos en los diferentes servicios. El promedio general de amplificación estuvo por debajo del 50%. El rango de amplificación por servicio va desde el 0%, hasta el 70%. Las razones por las que la PCR a partir de ADN aislado de parafinadas resulta inconsistente, se pueden resumir, a grosso modo, en: baja cantidad o ausencia de ADN blanco detectable, presencia de inhibidores, degradación del ADN total blanco y fragmentación de los ácidos nucleicos debido a la fijación en formalina. |
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