ADN mitocondrial soporta la baja diversidad genética de Tursiops truncatus (Artiodactyla: Delphinidae) en Bocas del Toro, Panamá y detecta nuevos haplotipos en el Caribe
Introducción: El delfín nariz de botella común (Tursiops truncatus) es uno de los cetáceos más estudiados a nivel mundial. Sin embargo, la información sobre la estructura genética de sus poblaciones silvestres es escasa en algunas regiones, como Centroamérica y el Caribe. Con base en datos de la Reg...
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| Formato: | Online |
| Idioma: | eng |
| Publicado: |
Universidad de Costa Rica
2023
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| Acceso en línea: | https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/rbt/article/view/57291 |
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RBT57291 |
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Universidad de Costa Rica |
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Revista de Biología Tropical |
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Duarte-Fajardo, María Alejandra Barragán-Barrera, Dalia C. Correa-Cárdenas, Camilo A. Pérez-Ortega, Betzi Farías-Curtidor, Nohelia Caballero, Susana |
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Duarte-Fajardo, María Alejandra Barragán-Barrera, Dalia C. Correa-Cárdenas, Camilo A. Pérez-Ortega, Betzi Farías-Curtidor, Nohelia Caballero, Susana ADN mitocondrial soporta la baja diversidad genética de Tursiops truncatus (Artiodactyla: Delphinidae) en Bocas del Toro, Panamá y detecta nuevos haplotipos en el Caribe |
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Duarte-Fajardo, María Alejandra Barragán-Barrera, Dalia C. Correa-Cárdenas, Camilo A. Pérez-Ortega, Betzi Farías-Curtidor, Nohelia Caballero, Susana |
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Duarte-Fajardo, María Alejandra |
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Introducción: El delfín nariz de botella común (Tursiops truncatus) es uno de los cetáceos más estudiados a nivel mundial. Sin embargo, la información sobre la estructura genética de sus poblaciones silvestres es escasa en algunas regiones, como Centroamérica y el Caribe. Con base en datos de la Región de Control del ADN mitocondrial (ADNmt-CR), dos formas genéticas han sido identificadas en el Caribe: la ‘forma inshore (o costera)’ y la ‘forma mundialmente distribuida’. En general, la forma costera se refiere a poblaciones costeras y altamente filopátricas que muestran baja diversidad genética. La forma mundialmente distribuida se refiere a poblaciones altamente móviles con individuos costeros y oceánicos que no muestran filopatría y generalmente muestran alta diversidad genética.
Objetivo: Para determinar el estado genético preliminar de los delfines nariz de botella comunes en La Guajira, Caribe colombiano, se realizó un análisis genético utilizando una porción hipervariable de ADNmt-CR. Los haplotipos obtenidos se compararon con muestras recolectadas en Panamá (probablemente la forma costera) y con haplotipos encontrados previamente en otras áreas del Caribe.
Métodos: En 2016 se obtuvo un total de 26 muestras de piel colectadas con el sistema de biopsia remota (PAXARMS) en dos localidades, La Guajira (Colombia, N=7) y Bocas del Toro (Panamá, N=19). Se extrajo el ADN, se sexaron las muestras, y un segmento de ADNmt-CR (~550-750 pb) se amplificó mediante PCR. Las secuencias de ADN amplificadas con éxito se revisaron y limpiaron manualmente; posteriormente, se compararon con 44 haplotipos reportados previamente en el Caribe.
Resultados: Las secuencias de ADNmt-CR de Bocas del Toro compartieron el mismo haplotipo costero único reportado previamente para esta población, mientras que las muestras de La Guajira representaron seis haplotipos nuevos, cinco pertenecientes a la forma mundialmente distribuida y uno a la forma costera. El análisis de la estructura de la población reveló dos filogrupos para el Caribe (FST=0.1353, ΦST=0.3330) con alta diversidad haplotípica: Panamá(Bocas del Toro)-Bahamas-Cuba-México (h=0.8489, π=4.2536 %) y Colombia-Costa Rica-Honduras-Puerto Rico (h=0.8837, π=4.2423 %).
Conclusiones: Estos hallazgos respaldan los resultados previamente reportados para los delfines nariz de botella comunes en Bocas del Toro-Panamá y refuerzan la necesidad de proteger a esta vulnerable población costera tratándola como una unidad de manejo poblacional única. Para La Guajira, estos resultados de ADNmt resultan en el primer esfuerzo por determinar la diversidad y estructura genética del delfín nariz de botella común en esta región, los cuales sugieren que ambas formas genéticas están presentes en el área, siendo la forma mundialmente distribuida la predominante. La conectividad potencial de esta última forma entre La Guajira-Colombia, Costa Rica y Honduras en Centroamérica destaca la necesidad de realizar más estudios genéticos y ecológicos para determinar las unidades de manejo apropiadas para esta especie en Centroamérica y el Caribe. |
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Mitochondrial DNA supports the low genetic diversity of Tursiops truncatus (Artiodactyla: Delphinidae) in Bocas del Toro, Panama and exhibits new Caribbean haplotypes |
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RBT572912023-10-30T15:39:35Z Mitochondrial DNA supports the low genetic diversity of Tursiops truncatus (Artiodactyla: Delphinidae) in Bocas del Toro, Panama and exhibits new Caribbean haplotypes ADN mitocondrial soporta la baja diversidad genética de Tursiops truncatus (Artiodactyla: Delphinidae) en Bocas del Toro, Panamá y detecta nuevos haplotipos en el Caribe Duarte-Fajardo, María Alejandra Barragán-Barrera, Dalia C. Correa-Cárdenas, Camilo A. Pérez-Ortega, Betzi Farías-Curtidor, Nohelia Caballero, Susana bottlenose dolphin; cetaceans; mtDNA; genetic diversity; La Guajira, Colombia, Central America. delfín nariz de botella; cetáceos; ADNmt; diversidad genética; La Guajira, Colombia, Centroamérica. Introduction: The common bottlenose dolphin (Tursiops truncatus) is one of the most studied cetaceans worldwide; however, information about the genetic structure of wild populations is scarce in some regions like Central America and the Caribbean. There are two known genetic forms identified in the Caribbean based on mitochondrial DNA Control Region (mtDNA-CR) data: the ‘inshore (or coastal) form’ and the ‘Worldwide distributed form’. In general, the inshore form refers to coastal and highly philopatric populations that show low genetic diversity. Worldwide distributed form refers to highly mobile populations with coastal and oceanic individuals that do not show philopatry and usually display high genetic diversity. Objective: To determine the preliminary genetic status of common bottlenose dolphins in La Guajira, Colombian Caribbean, using a hypervariable portion of mtDNA-CR. The obtained haplotypes were compared with samples collected in Panama (likely ‘inshore form’) and with haplotypes previously found in other areas of the Caribbean. Methods: In 2016, a total of 26 skin samples were obtained by remote biopsy system (PAXARMS) in two locations, La Guajira (Colombia, N=7) and Bocas del Toro (Panama, N=19). DNA was extracted, samples sexed, and a segment of mtDNA-CR (~550-750 bp) was amplified by PCR. The successfully amplified DNA sequences were manually reviewed and cleaned, and subsequently compared with 44 haplotypes previously reported for the Caribbean. Results: The mtDNA-CR sequences from Bocas del Toro shared the same unique inshore haplotype previously reported for this population, while the samples from La Guajira represented six novel haplotypes, five belonging to the Worldwide distributed form and one to the ‘inshore form.’ Population structure analysis revealed two phylogroups for the Caribbean (FST=0.1353, ΦST=0.3330) with high haplotype diversity: Panama(Bocas del Toro)-Bahamas-Cuba-Mexico (h=0.8489, π=4.2536 %) and Colombia-Costa Rica-Honduras-Puerto Rico (h=0.8837, π=4.2423 %). Conclusions: These findings support the results previously reported for common bottlenose dolphins in Bocas del Toro-Panama and reinforce the need to protect this vulnerable ‘inshore’ population by treating it as a unique population management unit. Mitochondrial DNA analysis of samples collected from La Guajira dolphins provide the first insight into the genetic diversity of common bottlenose dolphins in this region, indicating the presence of both inshore and Worldwide distributed genetic forms. The potential connectivity of this last form among La Guajira-Colombia, Costa Rica, and Honduras in Central America highlights the need for more genetic and ecological studies to determine the appropriate management units for this species in Central America and the Caribbean. Introducción: El delfín nariz de botella común (Tursiops truncatus) es uno de los cetáceos más estudiados a nivel mundial. Sin embargo, la información sobre la estructura genética de sus poblaciones silvestres es escasa en algunas regiones, como Centroamérica y el Caribe. Con base en datos de la Región de Control del ADN mitocondrial (ADNmt-CR), dos formas genéticas han sido identificadas en el Caribe: la ‘forma inshore (o costera)’ y la ‘forma mundialmente distribuida’. En general, la forma costera se refiere a poblaciones costeras y altamente filopátricas que muestran baja diversidad genética. La forma mundialmente distribuida se refiere a poblaciones altamente móviles con individuos costeros y oceánicos que no muestran filopatría y generalmente muestran alta diversidad genética. Objetivo: Para determinar el estado genético preliminar de los delfines nariz de botella comunes en La Guajira, Caribe colombiano, se realizó un análisis genético utilizando una porción hipervariable de ADNmt-CR. Los haplotipos obtenidos se compararon con muestras recolectadas en Panamá (probablemente la forma costera) y con haplotipos encontrados previamente en otras áreas del Caribe. Métodos: En 2016 se obtuvo un total de 26 muestras de piel colectadas con el sistema de biopsia remota (PAXARMS) en dos localidades, La Guajira (Colombia, N=7) y Bocas del Toro (Panamá, N=19). Se extrajo el ADN, se sexaron las muestras, y un segmento de ADNmt-CR (~550-750 pb) se amplificó mediante PCR. Las secuencias de ADN amplificadas con éxito se revisaron y limpiaron manualmente; posteriormente, se compararon con 44 haplotipos reportados previamente en el Caribe. Resultados: Las secuencias de ADNmt-CR de Bocas del Toro compartieron el mismo haplotipo costero único reportado previamente para esta población, mientras que las muestras de La Guajira representaron seis haplotipos nuevos, cinco pertenecientes a la forma mundialmente distribuida y uno a la forma costera. El análisis de la estructura de la población reveló dos filogrupos para el Caribe (FST=0.1353, ΦST=0.3330) con alta diversidad haplotípica: Panamá(Bocas del Toro)-Bahamas-Cuba-México (h=0.8489, π=4.2536 %) y Colombia-Costa Rica-Honduras-Puerto Rico (h=0.8837, π=4.2423 %). Conclusiones: Estos hallazgos respaldan los resultados previamente reportados para los delfines nariz de botella comunes en Bocas del Toro-Panamá y refuerzan la necesidad de proteger a esta vulnerable población costera tratándola como una unidad de manejo poblacional única. Para La Guajira, estos resultados de ADNmt resultan en el primer esfuerzo por determinar la diversidad y estructura genética del delfín nariz de botella común en esta región, los cuales sugieren que ambas formas genéticas están presentes en el área, siendo la forma mundialmente distribuida la predominante. 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