Avances de la bioinformática en Costa Rica: vista retrospectiva y perspectivas

Avances de la bioinformática en Costa Rica: vista retrospectiva y perspectivas

Introducción: La disciplina científica de la bioinformática tiene aplicaciones innovadoras para las sociedades humanas. Costa Rica, pequeña en tamaño y población en comparación con otros países de América Latina, ha ido adoptando la disciplina de manera progresiva. Reconocer los avances puede ayudar...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autores principales: Campos-Sánchez, Rebeca, Flores-Cruz, Andrés, Molina-Mora, José Arturo, Mora, Rodrigo, Rodríguez, César, Gatica, Andrés, Guzmán-Verri, Caterina
Formato: Online
Idioma:spa
Publicado: Universidad de Costa Rica 2021
Acceso en línea:https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/rbt/article/view/46873
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description Introducción: La disciplina científica de la bioinformática tiene aplicaciones innovadoras para las sociedades humanas. Costa Rica, pequeña en tamaño y población en comparación con otros países de América Latina, ha ido adoptando la disciplina de manera progresiva. Reconocer los avances puede ayudarnos a determinar hacia dónde queremos ir como país, así como también cómo podemos contribuir a la región latinoamericana. Objetivos: Este manuscrito revisa el impacto de la investigación bioinformática en Costa Rica, la aplicación de la ciencia, los desafíos y oportunidades en su desarrollo y su potencial contribución a la sociedad. Métodos: Evaluamos los avances en este campo de investigación, por lo que buscamos datos de publicaciones y repositorios de secuencias, así como información de actividades de capacitación, redes, infraestructura, páginas web y fuentes de financiamiento. Resultados: Observamos avances importantes desde el año 2010, incluyendo un aumento en oportunidades de entrenamiento y número de publicaciones, aportes significativos a las bases de datos de secuencias y conexiones por medio de redes. Sin embargo, ciertas áreas, como la masa crítica, el mapeo de grupos de investigación y la financiación requieren más atención. Conclusiones: Sugerimos que para beneficiarse de las aplicaciones de la bioinformática se deben fortalecer tres aspectos clave: la comunidad científica, la infraestructura de investigación y las oportunidades de financiamiento. La comunidad científica y sus patrocinadores deben promover la investigación basada en bioinformática, invertir en la formación de estudiantes de posgrado, aumentar la formación de profesionales, crear oportunidades laborales para carreras en bioinformática y promover colaboraciones internacionales a través de redes. El impacto de tal inversión sería el desarrollo de proyectos ambiciosos pero factibles y colaboraciones extendidas dentro de la región latinoamericana. Esto permitiría realizar contribuciones significativas para abordar los desafíos globales y la aplicación de nuevos enfoques de investigación, innovación y transferencia de conocimiento para el desarrollo de la economía, siempre considerando la ética de la investigación.
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spelling RBT468732022-02-16T15:17:24Z Bioinformatics advances in Costa Rica: retrospective view and perspectives Avances de la bioinformática en Costa Rica: vista retrospectiva y perspectivas Campos-Sánchez, Rebeca Flores-Cruz, Andrés Molina-Mora, José Arturo Mora, Rodrigo Rodríguez, César Gatica, Andrés Guzmán-Verri, Caterina data analysis NGS-next generation sequencing education Web of Science SRA (Sequence Read Archive) PubMed ENA (European Nucleotide Archive) análisis de datos NGS (Secuenciación de Nueva Generación) educación Web of Science SRA (Sequence Read Archive) PubMed ENA (European Nucleotide Archive) Introduction: The scientific discipline of bioinformatics has innovative applications for human societies. Costa Rica, small in size and population compared to other Latin American countries, has been progressively adopting the discipline. Recognizing progress can help us determine where we want to go as a country, as well as how we can contribute to the Latin American region. Objective: This manuscript reviews the impact of bioinformatics research in Costa Rica, the application of the science, the challenges and opportunities in its development, and its potential contribution to society. Methods: We evaluate progress in this research area, so we look for data from publications and sequence repositories, as well as information on training activities, networks, infrastructure, web pages and funding sources. Results: We have seen important advances since 2010, including an increase in training opportunities and the number of publications, significant contributions to the sequence databases and connections through networks. However, certain areas, such as critical mass, mapping of research groups, and funding require more attention. Conclusions: We suggest that to benefit from bioinformatics applications, three key aspects must be strengthened: the scientific community, the research infrastructure, and funding opportunities. The scientific community and its sponsors should promote bioinformatics-based research, invest in the training of graduate students, increase professional training, create career opportunities in bioinformatics, and promote international collaborations through networks. The impact of such investment would be the development of ambitious but feasible projects and extended collaborations within the Latin American region. This would allow significant contributions to be made to address global challenges and the application of new approaches to research, innovation and knowledge transfer for the development of the economy, always considering the ethics of research. Introducción: La disciplina científica de la bioinformática tiene aplicaciones innovadoras para las sociedades humanas. Costa Rica, pequeña en tamaño y población en comparación con otros países de América Latina, ha ido adoptando la disciplina de manera progresiva. Reconocer los avances puede ayudarnos a determinar hacia dónde queremos ir como país, así como también cómo podemos contribuir a la región latinoamericana. Objetivos: Este manuscrito revisa el impacto de la investigación bioinformática en Costa Rica, la aplicación de la ciencia, los desafíos y oportunidades en su desarrollo y su potencial contribución a la sociedad. Métodos: Evaluamos los avances en este campo de investigación, por lo que buscamos datos de publicaciones y repositorios de secuencias, así como información de actividades de capacitación, redes, infraestructura, páginas web y fuentes de financiamiento. Resultados: Observamos avances importantes desde el año 2010, incluyendo un aumento en oportunidades de entrenamiento y número de publicaciones, aportes significativos a las bases de datos de secuencias y conexiones por medio de redes. Sin embargo, ciertas áreas, como la masa crítica, el mapeo de grupos de investigación y la financiación requieren más atención. Conclusiones: Sugerimos que para beneficiarse de las aplicaciones de la bioinformática se deben fortalecer tres aspectos clave: la comunidad científica, la infraestructura de investigación y las oportunidades de financiamiento. La comunidad científica y sus patrocinadores deben promover la investigación basada en bioinformática, invertir en la formación de estudiantes de posgrado, aumentar la formación de profesionales, crear oportunidades laborales para carreras en bioinformática y promover colaboraciones internacionales a través de redes. El impacto de tal inversión sería el desarrollo de proyectos ambiciosos pero factibles y colaboraciones extendidas dentro de la región latinoamericana. Esto permitiría realizar contribuciones significativas para abordar los desafíos globales y la aplicación de nuevos enfoques de investigación, innovación y transferencia de conocimiento para el desarrollo de la economía, siempre considerando la ética de la investigación. Universidad de Costa Rica 2021-10-26 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion Article application/pdf text/html https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/rbt/article/view/46873 10.15517/rbt.v69i4.46873 Revista de Biología Tropical; Vol. 69 No. 4 (2021): Revista de Biología Tropical (Rev. Biol. Trop.): Continuous publication, October - December 2021; 1204–1223 Revista de Biología Tropical; Vol. 69 Núm. 4 (2021): Revista de Biología Tropical (Rev. Biol. Trop.): Publicación continua, Octubre - Diciembre 2021; 1204–1223 Revista Biología Tropical; Vol. 69 N.º 4 (2021): Revista de Biología Tropical (Rev. Biol. Trop.): Continuous publication, October - December 2021; 1204–1223 2215-2075 0034-7744 10.15517/rbt.v69i4 spa https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/rbt/article/view/46873/49058 https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/rbt/article/view/46873/49059 Copyright (c) 2021 Revista de Biología Tropical http://creativecommons.org/licenses/by/4.0

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