The STR polymorphism (AAAAT)n within the intron 1 of the tumor protein 53 (TP53) locus in 17 populations of different ethnic groups of Africa, America, Asia and Europe

The STR polymorphism (AAAAT)n within the intron 1 of the tumor protein 53 (TP53) locus in 17 populations of different ethnic groups of Africa, America, Asia and Europe

Se estudió el polimorfismo del microsatélite (AAAAT)n del intrón 1 del gene TP53 en 17 poblaciones de 3 grupos étnicos: europeos, asiáticos, y africanos subsaharianos, así como de la población híbrida de Costa Rica (en total 1968 muestras). Tres alelos, 126/7 (pares de bases/ copias de la repetición...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autores principales: Azofeifa, Jorge, Hahn, Meinhard, Ruiz, Edward, Hummerich, Lars, Morales, Ana I, Jiménez, Gerardo, Barrantes, Ramiro
Formato: Online
Idioma:eng
Publicado: Universidad de Costa Rica 2004
Acceso en línea:https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/rbt/article/view/15352
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spelling RBT153522022-05-30T17:30:27Z The STR polymorphism (AAAAT)n within the intron 1 of the tumor protein 53 (TP53) locus in 17 populations of different ethnic groups of Africa, America, Asia and Europe The STR polymorphism (AAAAT)n within the intron 1 of the tumor protein 53 (TP53) locus in 17 populations of different ethnic groups of Africa, America, Asia and Europe Azofeifa, Jorge Hahn, Meinhard Ruiz, Edward Hummerich, Lars Morales, Ana I Jiménez, Gerardo Barrantes, Ramiro population genetics microsatellite polymorphism europeans asiatics sub-saharan africans genetica de poblaciones microsatelites polimorfismos europeos asiaticos africanos del sub- sahara The STR (AAAAT)n within intron 1 of the TP53 locus was screened in 17 populations from 3 main ethnic groups: Europeans, Asiatics, and Africans, and from the hybrid population of Costa Rica (1968 samples). Three alleles, 126/7 (bp/copies of the repeat), 131/8 and 136/9 were the most prevalent in all populations. Other alleles rarely reached frequencies of 10% or higher. Observed heterozygosities ranged between 0.351 and 0.829. Patterns of diversity fit well with both the geographic origin of the samples and the history of the populations screened. A statistical test suggests that single-step mutational events have been the main mechanism producing new alleles at this locus. Fixation indexes (RST) for this marker showed an effect of population subdivision on divergence only within the Asiatic group; they were insensitive at the level of major ethnic groups as well as within Africans and within Europeans. Se estudió el polimorfismo del microsatélite (AAAAT)n del intrón 1 del gene TP53 en 17 poblaciones de 3 grupos étnicos: europeos, asiáticos, y africanos subsaharianos, así como de la población híbrida de Costa Rica (en total 1968 muestras). Tres alelos, 126/7 (pares de bases/ copias de la repetición), 131/8 y 136/9 fueron los más frecuentes en todas las poblaciones, aunque se observaron otros alelos usualmente a frecuencias menores al 10%. Las heterocigosis observadas variaron de 0.351 a 0.829. La distribución de la diversidad parece concordar con el origen geográfico de las muestras y con la historia de las poblaciones estudiadas. Una prueba estadística indica que el evento mutacional que más alelos nuevos produce en este marcador es el de un solo paso (expansión o contracción de una sola copia de la repetición). El índice de fijación RST mostró los efectos de la subdivision de poblaciones sólo dentro del grupo de los asiáticos y mostró falta de sensibilidad cuando los grupos comparados eran de niveles superiores de clasificación (europeos, asiáticos, y africanos) o cuando la comparación se hizo entre los grupos más antiguos (africanos y europeos). Universidad de Costa Rica 2004-09-01 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion Article application/pdf https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/rbt/article/view/15352 Revista de Biología Tropical; Vol. 52 No. 3 (2004): Volume 52 - Regular number 3 - September 2004; 645–657 Revista de Biología Tropical; Vol. 52 Núm. 3 (2004): Volumen 52 - Número regular 3 - Setiembre 2004; 645–657 Revista Biología Tropical; Vol. 52 N.º 3 (2004): Volume 52 - Regular number 3 - September 2004; 645–657 2215-2075 0034-7744 10.15517/rbt.v1i2 eng https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/rbt/article/view/15352/14670 Copyright (c) 2004 Revista de Biología Tropical http://creativecommons.org/licenses/by/4.0
institution Universidad de Costa Rica
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