Sumario: | Los arrecifes son sistemas muy complejos, cuya heterogeneidad mantiene una gran diversidad de organismos. La estructura de las comunidades de peces que forman parte del arrecife varía dentro y entre arrecifes, y se esperaría que la heterogeneidad y estructura del arrecife vaya a influir en la estructura de las comunidades de peces que habitan. Se estudiaron cuatro arrecifes en las Islas Catalinas (Sur, La Pared, Roca Sucia y Sombrero) y uno en la Playa de Ocotal, Pacífico Norte de Costa Rica. Se encontraron diferencias claras en la estructura y composición de las comunidades de peces de arrecife en las Islas Catalinas y Playa Ocotal, y la estructura y composición del hábitat explicaron la mayor parte de la varianza. Ciertos atributos del arrecife como la presencia del alga Caulerpa sertularoides en Ocotal, así como los corales Tubastrea coccinea y Pocillopora spp., en las Islas Catalinas explicaron la variabilidad que existía entre los sitios y como afectaba a la estructura de la comunidad de peces de arrecife. La mariposa Johnrandalia nigrirostris, la damisela Microspathodon dorsalis y el cirujano Prionurus punctatus se correlacionaron directamente con el coral ahermatípico Tubastrea coccinea, en el arrecife de Roca Sucia, mientras que Holocanthus passer se asocio a arrecifes con un mayor porcentaje de sustrato rocoso. Otras especies como Abudefduf troschelli y Halichoeres dispilus se encontraban en mayor cantidad en el arrecife de Ocotal, en donde dominaba el alga Caulerpa sertularioides. Por último, el número y abundancia de peces de arrecife se correlacionó directamente con el índice de rugosidad del sustrato en los arrecifes de Roca Sucia y Ocotal, pero no así los de la Pared y Sombrero.
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