Variaciones nucleotídicas de dos grupos de tepezcuintles, Agouti paca (Rodentia: Agoutidae), en cautiverio provenientes de dos localidades de Yucatán, México

Variaciones nucleotídicas de dos grupos de tepezcuintles, Agouti paca (Rodentia: Agoutidae), en cautiverio provenientes de dos localidades de Yucatán, México

Estimamos las variaciones nucleotídicas entre dos grupos de tepezcuintles (Agouti paca) provenientes de los estados de Campeche y Quintana Roo, México y, dentro de cada grupo. Se colectaron muestras sanguíneas de once A. paca mantenidos en cautiverio. El ADN de leucocitos se utilizó para efectuar la...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autores principales: Montes Pérez, Rubén C., Echeverría García, Adán W., Zavala Castro, Jorge, Alfaro Gamboa, Militza G
Formato: Online
Idioma:eng
spa
Publicado: Universidad de Costa Rica 2006
Acceso en línea:https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/rbt/article/view/13688
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description Estimamos las variaciones nucleotídicas entre dos grupos de tepezcuintles (Agouti paca) provenientes de los estados de Campeche y Quintana Roo, México y, dentro de cada grupo. Se colectaron muestras sanguíneas de once A. paca mantenidos en cautiverio. El ADN de leucocitos se utilizó para efectuar la amplificación aleatoria de polimorfismos de ADN (RAPD). Se seleccionaron los iniciadores número tres 5' -d(GTAGACCCGT)-3' y seis 5' -d(CCCGTCAGCA)-3' del estuche (Ready.To.Go. RAPD Analysis Beads, Amersham Pharmacia Biotech), porque produjeron un adecuado número de bandas. Los patrones electroforéticos de bandas fueron procesados con el software para análisis filogenético basado en el método de UPGMA para estimar la variación nucleotídica. El árbol filogenético obtenido con el iniciador tres reveló una agrupación dicotómica entre los animales de ambos estados de la Península de Yucatán, con un valor de divergencia de 1.983 nucleótidos de cada cien. Los animales de Quintana Roo mostraron un agrupamiento con el iniciador seis y, otro grupo más con animales procedentes de Campeche. La variación nucleotídica entre estos dos grupos fue de 2.118 nucleótidos por cada cien. Las variaciones nucleotídicas dentro de los grupos procedentes de ambos estados, para los dos iniciadores, mostraron valores que fluctuaron entre 0.46 y 1.68 nucleótidos de cada cien, lo cual indica que la variación nucleotídica entre los dos grupos de animales es alrededor de dos nucleótidos por cada cien y, dentro de grupos es menor a 1.7 nucleótidos por cada cien.
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title_alt Nucleotidic variations of two captive groups of tepezcuintle, Agouti paca (Rodentia: Agoutidae), from two sites in Yucatan, Mexico
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spelling RBT136882022-07-06T16:12:22Z Nucleotidic variations of two captive groups of tepezcuintle, Agouti paca (Rodentia: Agoutidae), from two sites in Yucatan, Mexico Variaciones nucleotídicas de dos grupos de tepezcuintles, Agouti paca (Rodentia: Agoutidae), en cautiverio provenientes de dos localidades de Yucatán, México Montes Pérez, Rubén C. Echeverría García, Adán W. Zavala Castro, Jorge Alfaro Gamboa, Militza G The objective of this work was to estimate the nucleotidic variation between two groups of tepezcuintles (Agouti paca) from the states of Campeche and Quintana Roo, Mexico and within members of each group. Blood samples were collected from eleven A. paca kept in captivity. DNA from leukocytic cells was used for Ramdom Amplification of DNA Polimorphism (RAPD). The primers three 5'-d(GTAGACCCGT)- 3' and six 5'-d(CCCGTCAGCA)- 3' were selected from de Amersham kit (Ready.To.Go. RAPD Analysis Beads, Amersham Pharmacia Biotech), because they produced an adequate number of bands. The electrophoretic pattern of bands obtained was analyzed using software for phylogenetic analysis based on the UPGMA method, to estimate the units of nucleotidic variation. The phylogenetic tree obtained with primer three reveals a dicotomic grouping between the animals from both states in the Yucatan Peninsula showing a divergent value of 1.983 nucleotides per hundred. Animals from Quintana Roo show a grouping with primer six; an additional grouping was observed with animals from Campeche. Nucleotidic variation between both groups was 2.118 nucleotides per hundred. The nucleotidic variation for the two primers within the groups from both states, showed fluctuating values from 0.46 to 1.68 nucleotides per hundred, which indicates that nucleotidic variation between the two groups of animals is around two nucleotides per hundred and, within the groups, less than 1.7 nucleotides per hundred.  Estimamos las variaciones nucleotídicas entre dos grupos de tepezcuintles (Agouti paca) provenientes de los estados de Campeche y Quintana Roo, México y, dentro de cada grupo. Se colectaron muestras sanguíneas de once A. paca mantenidos en cautiverio. El ADN de leucocitos se utilizó para efectuar la amplificación aleatoria de polimorfismos de ADN (RAPD). Se seleccionaron los iniciadores número tres 5' -d(GTAGACCCGT)-3' y seis 5' -d(CCCGTCAGCA)-3' del estuche (Ready.To.Go. RAPD Analysis Beads, Amersham Pharmacia Biotech), porque produjeron un adecuado número de bandas. Los patrones electroforéticos de bandas fueron procesados con el software para análisis filogenético basado en el método de UPGMA para estimar la variación nucleotídica. El árbol filogenético obtenido con el iniciador tres reveló una agrupación dicotómica entre los animales de ambos estados de la Península de Yucatán, con un valor de divergencia de 1.983 nucleótidos de cada cien. Los animales de Quintana Roo mostraron un agrupamiento con el iniciador seis y, otro grupo más con animales procedentes de Campeche. La variación nucleotídica entre estos dos grupos fue de 2.118 nucleótidos por cada cien. Las variaciones nucleotídicas dentro de los grupos procedentes de ambos estados, para los dos iniciadores, mostraron valores que fluctuaron entre 0.46 y 1.68 nucleótidos de cada cien, lo cual indica que la variación nucleotídica entre los dos grupos de animales es alrededor de dos nucleótidos por cada cien y, dentro de grupos es menor a 1.7 nucleótidos por cada cien. Universidad de Costa Rica 2006-09-01 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion Article application/pdf application/pdf https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/rbt/article/view/13688 10.15517/rbt.v54i3.13688 Revista de Biología Tropical; Vol. 54 No. 3 (2006): Volume 54 – Regular number 3 – September 2006; 911–917 Revista de Biología Tropical; Vol. 54 Núm. 3 (2006): Volumen 54 – Número regular 3 – Setiembre 2006; 911–917 Revista Biología Tropical; Vol. 54 N.º 3 (2006): Volume 54 – Regular number 3 – September 2006; 911–917 2215-2075 0034-7744 10.15517/rbt.v54i3 eng spa https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/rbt/article/view/13688/13009 https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/rbt/article/view/13688/13010 Copyright (c) 2006 Revista de Biología Tropical http://creativecommons.org/licenses/by/4.0

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