Análisis estadístico de la determinación de la reproducibilidad del estudio del sistema de prueba desarrollado para la detección del ADN del virus de la peste porcina africana

El objetivo del estudio era desarrollar un sistema de prueba basado en la amplificación isotérmica mediada por bucle con detección por hibridación-fluorescencia para detectar el ADN del virus de la peste porcina africana en presencia de una muestra de control interno. Como parte del estudio, se dete...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autores principales:	Gnezdilova, Larisa, Pozyabin, Sergey, Selina, Marina, Borunova, Seidfatima
Formato:	Online
Idioma:	eng
Publicado:	Universidad Nacional de Ingeniería (UNI) en Managua 2023
Acceso en línea:	https://www.camjol.info/index.php/NEXO/article/view/16817

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spelling	NEXO168172023-10-20T22:06:11Z Statistical analysis of determining the reproducibility of the study of the developed test system for detecting African swine fever virus DNA Análisis estadístico de la determinación de la reproducibilidad del estudio del sistema de prueba desarrollado para la detección del ADN del virus de la peste porcina africana Gnezdilova, Larisa Pozyabin, Sergey Selina, Marina Borunova, Seidfatima infectious diseases animals genetics molecular genetic studies polymerase chain reaction statistical data analysis enfermedades infecciosas animales genética estudios de genética molecular reacción en cadena de la polimerasa análisis estadístico de datos The study aimed to develop a loop-mediated isothermal amplification-based test system with hybridization-fluorescence detection to detect the DNA of the African swine fever virus in the presence of an internal control sample. As part of the study, optimal amplification conditions were determined, a method of nucleic acid extraction was selected, and the amplification of positive and negative samples was analyzed. Statistical analysis was carried out to determine the reproducibility of the study of the developed test system. The genetic features of the African swine fever virus were studied, and the most promising fragment of the genome for the specific identification of this pathogen, the major capsid protein p72 gene, was identified. Oligonucleotides were selected for isothermal amplification of the target. The results of the study are valuable from the point of view of further developments in virology, epidemiology, and diagnostics and can also be used by organizations and institutions involved in the control and prevention of animal diseases, in particular African swine fever. El objetivo del estudio era desarrollar un sistema de prueba basado en la amplificación isotérmica mediada por bucle con detección por hibridación-fluorescencia para detectar el ADN del virus de la peste porcina africana en presencia de una muestra de control interno. Como parte del estudio, se determinaron las condiciones óptimas de amplificación, se seleccionó un método de extracción de ácidos nucleicos y se analizó la amplificación de muestras positivas y negativas. Se llevó a cabo un análisis estadístico para determinar la reproducibilidad del estudio del sistema de prueba desarrollado. Se estudiaron las características genéticas del virus de la peste porcina africana y se identificó el fragmento del genoma más prometedor para la identificación específica de este patógeno, el gen de la proteína p72 de la cápside mayor. Se seleccionaron oligonucleótidos para la amplificación isotérmica de la diana. Los resultados del estudio son valiosos desde el punto de vista de futuros avances en virología, epidemiología y diagnóstico, y también pueden ser utilizados por organizaciones e instituciones implicadas en el control y la prevención de enfermedades animales, en particular la peste porcina africana. Universidad Nacional de Ingeniería (UNI) en Managua 2023-10-12 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion Peer-Reviewed Article Artículo revisado por pares application/pdf https://www.camjol.info/index.php/NEXO/article/view/16817 10.5377/nexo.v36i04.16817 Nexo Scientific Journal; Vol. 36 No. 04 (2023); 736–742 Nexo Revista Científica; Vol. 36 Núm. 04 (2023); 736–742 1995-9516 1818-6742 eng https://www.camjol.info/index.php/NEXO/article/view/16817/20110 Copyright (c) 2023 Universidad Nacional de Ingeniería http://creativecommons.org/licenses/by/4.0
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