Extraction and amplification of DNA from orchid exsiccates conserved for more than half a century in a herbarium in Bogotá, Colombia

Los tejidos vegetales provenientes de muestras de herbario contienen ADN que ha sufrido degradación post-mortem. Solo pequeñas cantidades de material genético eventualmente degradado, libre de químicos e impurezas, puede ser extraído de dichas muestras. El presente trabajo buscó comparar y determina...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autores principales:	Mazo, Laura C., Gómez, Alberto, Quintanilla, Sonia R., Bernal, Jaime E., Ortiz Valdivieso, Pedro
Formato:	Online
Idioma:	eng
Publicado:	Universidad de Costa Rica 2013
Acceso en línea:	https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/lankesteriana/article/view/11762

id	LANKESTERIANA11762
record_format	ojs
spelling	LANKESTERIANA117622022-07-20T01:01:07Z Extraction and amplification of DNA from orchid exsiccates conserved for more than half a century in a herbarium in Bogotá, Colombia Extraction and amplification of DNA from orchid exsiccates conserved for more than half a century in a herbarium in Bogotá, Colombia Mazo, Laura C. Gómez, Alberto Quintanilla, Sonia R. Bernal, Jaime E. Ortiz Valdivieso, Pedro dna adna orchids matk exsiccates herbarium dna adna orchids matk exsiccates herbarium Plant tissue from herbarium specimens contains DNA that has undergone post-mortem degradation. Only small amounts of possibly degraded genetic material free of chemicals and impurities can be extracted from these samples. The aim of the present work was to compare and determine which one of three previously published plant DNA extraction protocols would extract good quality DNA from orchid herbarium specimens stored up to 63 years, susceptible of PCR amplification and Sanger sequencing. The most effective protocol for this type of samples allowed us to obtain and sequence amplified products in 6 of the 7 samples studied with an optimal DNA / protein purity relationship. Los tejidos vegetales provenientes de muestras de herbario contienen ADN que ha sufrido degradación post-mortem. Solo pequeñas cantidades de material genético eventualmente degradado, libre de químicos e impurezas, puede ser extraído de dichas muestras. El presente trabajo buscó comparar y determinar cuál de los tres protocolos de extracción seleccionados, que habían sido publicados previamente para ADN vegetal, permitía extraer ADN de buena calidad, susceptible de ser amplificado y secuenciado, a partir de exsicados de orquídeas conservadas en herbario hasta por 63 años. De los protocolos evaluados, el más eficaz permitió obtener y secuenciar productos amplificados en 6 de las 7 muestras estudiadas, con las mejores relaciones de pureza ADN / proteína. Universidad de Costa Rica 2013-09-04 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion Article application/pdf https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/lankesteriana/article/view/11762 10.15517/lank.v0i0.11762 Lankesteriana: International Journal on Orchidology; 2012: Lankesteriana: Volumen 12, Número 2 Lankesteriana: International Journal on Orchidology; 2012: Lankesteriana: Volumen 12, Número 2 2215-2067 1409-3871 eng https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/lankesteriana/article/view/11762/11079
institution	Universidad de Costa Rica
collection	Lankesteriana: International Journal on Orchidology
language	eng
format	Online
author	Mazo, Laura C. Gómez, Alberto Quintanilla, Sonia R. Bernal, Jaime E. Ortiz Valdivieso, Pedro
spellingShingle	Mazo, Laura C. Gómez, Alberto Quintanilla, Sonia R. Bernal, Jaime E. Ortiz Valdivieso, Pedro Extraction and amplification of DNA from orchid exsiccates conserved for more than half a century in a herbarium in Bogotá, Colombia
author_facet	Mazo, Laura C. Gómez, Alberto Quintanilla, Sonia R. Bernal, Jaime E. Ortiz Valdivieso, Pedro
author_sort	Mazo, Laura C.
description	Los tejidos vegetales provenientes de muestras de herbario contienen ADN que ha sufrido degradación post-mortem. Solo pequeñas cantidades de material genético eventualmente degradado, libre de químicos e impurezas, puede ser extraído de dichas muestras. El presente trabajo buscó comparar y determinar cuál de los tres protocolos de extracción seleccionados, que habían sido publicados previamente para ADN vegetal, permitía extraer ADN de buena calidad, susceptible de ser amplificado y secuenciado, a partir de exsicados de orquídeas conservadas en herbario hasta por 63 años. De los protocolos evaluados, el más eficaz permitió obtener y secuenciar productos amplificados en 6 de las 7 muestras estudiadas, con las mejores relaciones de pureza ADN / proteína.
title	Extraction and amplification of DNA from orchid exsiccates conserved for more than half a century in a herbarium in Bogotá, Colombia
title_short	Extraction and amplification of DNA from orchid exsiccates conserved for more than half a century in a herbarium in Bogotá, Colombia
title_full	Extraction and amplification of DNA from orchid exsiccates conserved for more than half a century in a herbarium in Bogotá, Colombia
title_fullStr	Extraction and amplification of DNA from orchid exsiccates conserved for more than half a century in a herbarium in Bogotá, Colombia
title_full_unstemmed	Extraction and amplification of DNA from orchid exsiccates conserved for more than half a century in a herbarium in Bogotá, Colombia
title_sort	extraction and amplification of dna from orchid exsiccates conserved for more than half a century in a herbarium in bogotá, colombia
title_alt	Extraction and amplification of DNA from orchid exsiccates conserved for more than half a century in a herbarium in Bogotá, Colombia
publisher	Universidad de Costa Rica
publishDate	2013
url	https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/lankesteriana/article/view/11762
work_keys_str_mv	AT mazolaurac extractionandamplificationofdnafromorchidexsiccatesconservedformorethanhalfacenturyinaherbariuminbogotacolombia AT gomezalberto extractionandamplificationofdnafromorchidexsiccatesconservedformorethanhalfacenturyinaherbariuminbogotacolombia AT quintanillasoniar extractionandamplificationofdnafromorchidexsiccatesconservedformorethanhalfacenturyinaherbariuminbogotacolombia AT bernaljaimee extractionandamplificationofdnafromorchidexsiccatesconservedformorethanhalfacenturyinaherbariuminbogotacolombia AT ortizvaldiviesopedro extractionandamplificationofdnafromorchidexsiccatesconservedformorethanhalfacenturyinaherbariuminbogotacolombia
_version_	1810112907358240768

Extraction and amplification of DNA from orchid exsiccates conserved for more than half a century in a herbarium in Bogotá, Colombia

Ejemplares similares