Identificación de marcadores moleculares (SNP) y genes candidatos asociados a la tolerancia genética al complejo mancha de asfalto en variedades nativas de maíz (Zea mays L.)

El complejo mancha de asfalto (CMA) en maíz (Zea mays L.), causado por los hongos Phyllachora maydis Maubl. y Monographella maydis Müller & Samuels, es una enfermedad de importancia económica en Guatemala, causando pérdida en el rendimiento entre 30 a 50%, inclusive del 100% si las condicion...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autores principales: González-Diéguez, David O., Orozco, Carlos
Formato: Online
Idioma:spa
Publicado: Universidad de San Carlos de Guatemala 2021
Acceso en línea:https://revistas.usac.edu.gt/index.php/cytes/article/view/826
id CYTES826
record_format ojs
spelling CYTES8262023-07-05T20:07:08Z Identificación de marcadores moleculares (SNP) y genes candidatos asociados a la tolerancia genética al complejo mancha de asfalto en variedades nativas de maíz (Zea mays L.) González-Diéguez, David O. Orozco, Carlos El complejo mancha de asfalto (CMA) en maíz (Zea mays L.), causado por los hongos Phyllachora maydis Maubl. y Monographella maydis Müller & Samuels, es una enfermedad de importancia económica en Guatemala, causando pérdida en el rendimiento entre 30 a 50%, inclusive del 100% si las condiciones son favorables. El objetivo de esta investigación fue identificar marcadores de un solo nucleótido o SNP (Single Nucleotide Polymorphism, por sus siglas en inglés) y genes candidatos asociados a la tolerancia genética al CMA. Para ello se analizaron 463 poblaciones nativas y 329,692 SNP, y se compararon dos modelos genómicos, single marker y BayesB, para la identificación de regiones asociadas a la tolerancia genética al CMA. Se identificaron 40 marcadores SNP asociados significativamente a la tolerancia genética al CMA con ambos modelos. La proporción de variación fenotípica total explicada (PVE) por los 40 SNPs fue de 56%, atribuida a efectos genéticos aditivos. Múltiples genes de resistencia fueron identificados en las regiones señaladas por los marcadores SNP, siendo sus principales funciones receptores y transductores de señal, factores de transcripción que regulan positivamente la expresión de genes de resistencia y genes de la familia kinasa, por lo que potencialmente están involucrados en el mecanismo de defensa al CMA. Universidad de San Carlos de Guatemala 2021-02-15 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion Artículos Científicos application/pdf https://revistas.usac.edu.gt/index.php/cytes/article/view/826 10.36829/63CTS.v7i2.826 Ciencia, Tecnología y Salud; Vol. 7 No. 2; 218-235 Ciencia, Tecnologí­a y Salud; Vol. 7 Núm. 2; 218-235 2409-3459 2410-6356 spa https://revistas.usac.edu.gt/index.php/cytes/article/view/826/731 Derechos de autor 2020 David O. González-Diéguez, Carlos Orozco https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0
institution Universidad de San Carlos de Guatemala
collection Ciencia, Tecnología y Salud
language spa
format Online
author González-Diéguez, David O.
Orozco, Carlos
spellingShingle González-Diéguez, David O.
Orozco, Carlos
Identificación de marcadores moleculares (SNP) y genes candidatos asociados a la tolerancia genética al complejo mancha de asfalto en variedades nativas de maíz (Zea mays L.)
author_facet González-Diéguez, David O.
Orozco, Carlos
author_sort González-Diéguez, David O.
description El complejo mancha de asfalto (CMA) en maíz (Zea mays L.), causado por los hongos Phyllachora maydis Maubl. y Monographella maydis Müller & Samuels, es una enfermedad de importancia económica en Guatemala, causando pérdida en el rendimiento entre 30 a 50%, inclusive del 100% si las condiciones son favorables. El objetivo de esta investigación fue identificar marcadores de un solo nucleótido o SNP (Single Nucleotide Polymorphism, por sus siglas en inglés) y genes candidatos asociados a la tolerancia genética al CMA. Para ello se analizaron 463 poblaciones nativas y 329,692 SNP, y se compararon dos modelos genómicos, single marker y BayesB, para la identificación de regiones asociadas a la tolerancia genética al CMA. Se identificaron 40 marcadores SNP asociados significativamente a la tolerancia genética al CMA con ambos modelos. La proporción de variación fenotípica total explicada (PVE) por los 40 SNPs fue de 56%, atribuida a efectos genéticos aditivos. Múltiples genes de resistencia fueron identificados en las regiones señaladas por los marcadores SNP, siendo sus principales funciones receptores y transductores de señal, factores de transcripción que regulan positivamente la expresión de genes de resistencia y genes de la familia kinasa, por lo que potencialmente están involucrados en el mecanismo de defensa al CMA.
title Identificación de marcadores moleculares (SNP) y genes candidatos asociados a la tolerancia genética al complejo mancha de asfalto en variedades nativas de maíz (Zea mays L.)
title_short Identificación de marcadores moleculares (SNP) y genes candidatos asociados a la tolerancia genética al complejo mancha de asfalto en variedades nativas de maíz (Zea mays L.)
title_full Identificación de marcadores moleculares (SNP) y genes candidatos asociados a la tolerancia genética al complejo mancha de asfalto en variedades nativas de maíz (Zea mays L.)
title_fullStr Identificación de marcadores moleculares (SNP) y genes candidatos asociados a la tolerancia genética al complejo mancha de asfalto en variedades nativas de maíz (Zea mays L.)
title_full_unstemmed Identificación de marcadores moleculares (SNP) y genes candidatos asociados a la tolerancia genética al complejo mancha de asfalto en variedades nativas de maíz (Zea mays L.)
title_sort identificación de marcadores moleculares (snp) y genes candidatos asociados a la tolerancia genética al complejo mancha de asfalto en variedades nativas de maíz (zea mays l.)
publisher Universidad de San Carlos de Guatemala
publishDate 2021
url https://revistas.usac.edu.gt/index.php/cytes/article/view/826
work_keys_str_mv AT gonzalezdieguezdavido identificaciondemarcadoresmolecularessnpygenescandidatosasociadosalatoleranciageneticaalcomplejomanchadeasfaltoenvariedadesnativasdemaizzeamaysl
AT orozcocarlos identificaciondemarcadoresmolecularessnpygenescandidatosasociadosalatoleranciageneticaalcomplejomanchadeasfaltoenvariedadesnativasdemaizzeamaysl
_version_ 1781384275752386560