Caracterización de tres ADNc obtenidos mediante cribado por PCR de una genoteca de Taenia solium

Caracterización de tres ADNc obtenidos mediante cribado por PCR de una genoteca de Taenia solium

Los cisticercos de Taenia solium causan cisticercosis, y la neurocisticercosis (NCC) es la principal patología. La caracterización de genes es fundamental para el conocimiento de la biología del parásito, la relación parásito-hospedador y la identificación de posibles dianas de diagnóstico, tratamie...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autores principales: Garrido, Oswgladys, Ferrer, Elizabeth
Formato: Online
Idioma:eng
Publicado: Universidad Nacional, Costa Rica 2022
Acceso en línea:https://www.revistas.una.ac.cr/index.php/uniciencia/article/view/15998
id UNICIENCIA15998
record_format ojs
institution Universidad Nacional de Costa Rica
collection Uniciencia
language eng
format Online
author Garrido, Oswgladys
Ferrer, Elizabeth
spellingShingle Garrido, Oswgladys
Ferrer, Elizabeth
Caracterización de tres ADNc obtenidos mediante cribado por PCR de una genoteca de Taenia solium
author_facet Garrido, Oswgladys
Ferrer, Elizabeth
author_sort Garrido, Oswgladys
description Los cisticercos de Taenia solium causan cisticercosis, y la neurocisticercosis (NCC) es la principal patología. La caracterización de genes es fundamental para el conocimiento de la biología del parásito, la relación parásito-hospedador y la identificación de posibles dianas de diagnóstico, tratamiento y protección. El objetivo de este trabajo fue la caracterización molecular y bioinformática, de tres ADN complementarios (ADNc) (TsTF10, TsAAP8 y TsrGAP8), obtenidos por cribado por PCR de una genoteca de Taenia solium. Las secuencias se compararon con las de las bases de datos de ácidos nucleicos y proteínas (GenBank, EMBL) y se analizaron mediante programas bioinformáticos (CDD-Search del Centro Nacional de Información Biotecnológica, Interpro del Instituto Europeo de Bioinformática, Motif scan y Sistema de Análisis de Proteínas del Instituto Suizo de Bioinformatica). Teniendo en cuenta las altas identidades con moléculas similares de helmintos relacionados (Taenia asiatica, Echinococcus granulosus, E. multilocularis e Hymenolepis diminuta) y los dominios funcionales encontrados, los genes de Taenia, TsTF10, TsAAP8 y TsrGAP8 podrían actuar como un factor de transcripción nuclear gamma, una supuesta proteína asociada a ATPasa vacuolar de membrana y una proteína activadora de Rho GTPasa, respectivamente. Aunque pocos epítopos B pudieron predecirse en las secuencias, podría ser relevante valorarlos como posibles candidatos para diagnóstico y protección en cisticercosis. La caracterización y análisis de estas secuencias y la predicción de su posible utilidad como antígenos, vacunas o dianas terapéuticas ayudan al diseño y planificación de estudios futuros.
title Caracterización de tres ADNc obtenidos mediante cribado por PCR de una genoteca de Taenia solium
title_short Caracterización de tres ADNc obtenidos mediante cribado por PCR de una genoteca de Taenia solium
title_full Caracterización de tres ADNc obtenidos mediante cribado por PCR de una genoteca de Taenia solium
title_fullStr Caracterización de tres ADNc obtenidos mediante cribado por PCR de una genoteca de Taenia solium
title_full_unstemmed Caracterización de tres ADNc obtenidos mediante cribado por PCR de una genoteca de Taenia solium
title_sort caracterización de tres adnc obtenidos mediante cribado por pcr de una genoteca de taenia solium
title_alt Characterization of Three cDNAs Obtained by Spliced Leader-PCR Screening of a Taenia solium cDNA Library
Caracterização de três cDNA obtidos pela triagem de PCR de uma biblioteca de DNA de Taenia solium
publisher Universidad Nacional, Costa Rica
publishDate 2022
url https://www.revistas.una.ac.cr/index.php/uniciencia/article/view/15998
work_keys_str_mv AT garridooswgladys characterizationofthreecdnasobtainedbysplicedleaderpcrscreeningofataeniasoliumcdnalibrary
AT ferrerelizabeth characterizationofthreecdnasobtainedbysplicedleaderpcrscreeningofataeniasoliumcdnalibrary
AT garridooswgladys caracterizaciondetresadncobtenidosmediantecribadoporpcrdeunagenotecadetaeniasolium
AT ferrerelizabeth caracterizaciondetresadncobtenidosmediantecribadoporpcrdeunagenotecadetaeniasolium
AT garridooswgladys caracterizacaodetrescdnaobtidospelatriagemdepcrdeumabibliotecadednadetaeniasolium
AT ferrerelizabeth caracterizacaodetrescdnaobtidospelatriagemdepcrdeumabibliotecadednadetaeniasolium
_version_ 1782035763150454784
spelling UNICIENCIA159982022-06-14T15:37:26Z Characterization of Three cDNAs Obtained by Spliced Leader-PCR Screening of a Taenia solium cDNA Library Caracterización de tres ADNc obtenidos mediante cribado por PCR de una genoteca de Taenia solium Caracterização de três cDNA obtidos pela triagem de PCR de uma biblioteca de DNA de Taenia solium Garrido, Oswgladys Ferrer, Elizabeth Cysticerci or metacestodes of Taenia solium cause cysticercosis, being the neurocysticercosis (NCC) the main pathology. The characterization of genes is essential for the knowledge of parasite biology, the understanding of the parasite-host relationship, and the identification of possible targets for diagnosis, treatment, and protection. The objective of this work was the molecular and bioinformatic characterization of three news cDNAs (TsTF10, TsAAP8, and TsrGAP8), obtained by spliced leader-PCR screening of a Taenia solium cDNA library. The sequences of the three cDNA were compared with the sequences in the nucleic acid and protein databases (GenBank, EMBL) and analyzed by bioinformatic programs (CDD-Search of the National Center for Biotechnology Information, Interpro of the European Bioinformatics Institute, Motif scan and Expert Protein Analysis System of the Proteomics Server from Swiss Institute of Bioinformatics). Considering the high identities with similar molecules of related helminths (Taenia asiatica, Echinococcus granulosus, Echinococcus multilocularis, and Hymenolepis diminuta) and the functional domains found, the TsTF10, TsAAP8, and TsrGAP8 genes of Taenia could act as a nuclear transcription factor gamma, a putative vacuolar ATPase membrane sector associated protein and a Rho GTPase activating protein, respectively. Although few B epitopes could be predicted in the sequences, it could be relevant to evaluate them as possible candidates for diagnosis and protection in cysticercosis. The characterization and analysis of these sequences and the prediction of their possible usefulness as antigens, vaccines, or therapeutic targets contribute to the designing and planning of future studies. Los cisticercos de Taenia solium causan cisticercosis, y la neurocisticercosis (NCC) es la principal patología. La caracterización de genes es fundamental para el conocimiento de la biología del parásito, la relación parásito-hospedador y la identificación de posibles dianas de diagnóstico, tratamiento y protección. El objetivo de este trabajo fue la caracterización molecular y bioinformática, de tres ADN complementarios (ADNc) (TsTF10, TsAAP8 y TsrGAP8), obtenidos por cribado por PCR de una genoteca de Taenia solium. Las secuencias se compararon con las de las bases de datos de ácidos nucleicos y proteínas (GenBank, EMBL) y se analizaron mediante programas bioinformáticos (CDD-Search del Centro Nacional de Información Biotecnológica, Interpro del Instituto Europeo de Bioinformática, Motif scan y Sistema de Análisis de Proteínas del Instituto Suizo de Bioinformatica). Teniendo en cuenta las altas identidades con moléculas similares de helmintos relacionados (Taenia asiatica, Echinococcus granulosus, E. multilocularis e Hymenolepis diminuta) y los dominios funcionales encontrados, los genes de Taenia, TsTF10, TsAAP8 y TsrGAP8 podrían actuar como un factor de transcripción nuclear gamma, una supuesta proteína asociada a ATPasa vacuolar de membrana y una proteína activadora de Rho GTPasa, respectivamente. Aunque pocos epítopos B pudieron predecirse en las secuencias, podría ser relevante valorarlos como posibles candidatos para diagnóstico y protección en cisticercosis. La caracterización y análisis de estas secuencias y la predicción de su posible utilidad como antígenos, vacunas o dianas terapéuticas ayudan al diseño y planificación de estudios futuros. Os cisticercos da Taenia solium causam cisticercose, e a neurocisticercose (NCC) é a principal patologia. A caracterização dos genes é fundamental para o conhecimento da biologia do parasita, da relação parasita-hospedeiro e da identificação de possíveis alvos de diagnóstico, tratamento e proteção. O objetivo deste trabalho foi a caracterização molecular e bioinformática de três DNA complementar (cDNA) (TsTF10, TsAAP8 e TsrGAP8), obtidos pela triagem de PCR de uma biblioteca de DNA de Taenia solium. As sequências foram comparadas com as dos bancos de dados de ácidos nucleicos e proteína (GenBank, EMBL) e analisadas por meio de programas de bioinformática (CDD-Search do Centro Nacional de Informações Biotecnológicas, Interpro do Instituto Europeu de Bioinformática, Motif scan e Sistema de Análise de Proteínas do Instituto Suíço de Bioinformática). Considerando as altas identidades com moléculas semelhantes de helmintos relacionados (Taenia asiatica, Echinococcus granulosus, E. multilocularis e Hymenolepis diminuta) e os domínios funcionais encontrados, os genes de Taenia, TsTF10, TsAAP8 e TsrGAP8 poderiam atuar como um fator de transcrição nuclear gama, uma suposta proteína associada à ATPase vacuolar de membrana ATPase e uma proteína ativadora de Rho GTPase, respectivamente. Embora poucos epítopos B pudessem ser previstos nas sequências, poderia ser relevante avaliá-los como possíveis candidatos ao diagnóstico e à proteção em cisticercose. A caracterização e análise dessas sequências e a previsão de sua possível utilidade como antígenos, vacinas ou alvos terapêuticos ajudam no desenho e planejamento de estudos futuros. Universidad Nacional, Costa Rica 2022-06-01 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion Papers evaluated by academic peers Artículos evaluados por pares académicos application/pdf text/html application/epub+zip https://www.revistas.una.ac.cr/index.php/uniciencia/article/view/15998 10.15359/ru.36-1.31 Uniciencia; Vol 36 No 1 (2022): Uniciencia. January-December, 2022; 1-10 Uniciencia; Vol. 36 Núm. 1 (2022): Uniciencia. January-December, 2022; 1-10 Uniciencia; v. 36 n. 1 (2022): Uniciencia. January-December, 2022; 1-10 2215-3470 eng https://www.revistas.una.ac.cr/index.php/uniciencia/article/view/15998/25154 https://www.revistas.una.ac.cr/index.php/uniciencia/article/view/15998/25155 https://www.revistas.una.ac.cr/index.php/uniciencia/article/view/15998/25156 Copyright (c) 2022 Shared by Journal and Authors (CC-BY-NC-ND) http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0

Ejemplares similares