Amplificación isotérmica mediada por bucle de transcripción inversa y protocolos alternativos para pruebas COVID-19 a gran escala y de bajo costo: lecciones de una economía emergente
Introducción: la mayoría de los casos exitosos de mitigación y manejo de la pandemia de COVID-19 se han dado mediante pruebas basadas en la reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa (RT-qPCR por sus siglas en inglés). Sin embargo, muchas economías emergentes han tenido probl...
Autores principales: | , , , , |
---|---|
Formato: | Online |
Idioma: | eng |
Publicado: |
Universidad de Costa Rica
2022
|
Acceso en línea: | https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/rbt/article/view/47407 |
id |
RBT47407 |
---|---|
record_format |
ojs |
spelling |
RBT474072022-10-17T16:25:58Z Reverse-Transcription Loop-Mediated Isothermal Amplification and alternative protocols for lower cost, large-scale COVID-19 testing: lessons from an emerging economy Amplificación isotérmica mediada por bucle de transcripción inversa y protocolos alternativos para pruebas COVID-19 a gran escala y de bajo costo: lecciones de una economía emergente Segura-Ulate, Ismael Bolívar-González, Alejandro Madrigal-Redondo, Germán Nuñez-Corrales, Santiago Gatica-Arias, Andrés emerging economies molecular testing SARS-CoV-2 saliva loop mediated isothermal amplification economías emergentes pruebas moleculares SARS-CoV-2 saliva amplificación isotérmica mediada por bucle Introduction: Most successful cases of COVID-19 pandemic mitigation and handling have relied on extensive reverse-transcription quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR). However, many emerging economies have struggled with current molecular testing demands due to economic, technical and technological constraints. Objective: To define a potential diagnostic protocol to increase testing capacity in current and post-pandemic conditions. Methods: We reviewed the literature, patents and commercial applications, for alternatives. Results: We found a good potential in saliva samples, viral inactivation and quick RNA extraction by heating; the use of an isothermal technology such as loop mediated isothermal amplification (LAMP) and naked eye test-result visualization by in-tube colorimetry or turbidity. Conclusions: Saliva samples with quick RNA extraction by heating and colorimetric LAMP are promising options for countries with economic and infrastructure limitations. Introducción: la mayoría de los casos exitosos de mitigación y manejo de la pandemia de COVID-19 se han dado mediante pruebas basadas en la reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa (RT-qPCR por sus siglas en inglés). Sin embargo, muchas economías emergentes han tenido problemas con las demandas actuales de pruebas moleculares debido a limitaciones económicas, técnicas y tecnológicas. Objetivo: Definir un protocolo de diagnóstico potencial para aumentar la capacidad de prueba en las condiciones actuales y posteriores a la pandemia. Métodos: Revisamos la literatura, las patentes y las aplicaciones comerciales, en busca de alternativas. Resultados: Encontramos un buen potencial en muestras de saliva, inactivación viral y extracción rápida de ARN por calentamiento; el uso de una tecnología isotérmica como la amplificación isotérmica mediada por horquillas (LAMP, por sus siglas en inglés) y la visualización del resultado de la prueba a simple vista mediante colorimetría o turbidez en el tubo. Conclusiones: Las muestras de saliva con extracción rápida de ARN por calentamiento y LAMP colorimétrico son opciones prometedoras para países con limitaciones económicas y de infraestructura. Universidad de Costa Rica 2022-03-18 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion Article application/pdf text/html https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/rbt/article/view/47407 10.15517/rev.biol.trop..v70i1.47407 Revista de Biología Tropical; Vol. 70 No. 1 (2022): Revista de Biología Tropical (Rev. Biol. Trop.): Continuous publication, 01 January - 31 December 2022; 173–189 Revista de Biología Tropical; Vol. 70 Núm. 1 (2022): Revista de Biología Tropical (Rev. Biol. Trop.): Publicación continua, Enero - Diciembre 2022; 173–189 Revista Biología Tropical; Vol. 70 N.º 1 (2022): Revista de Biología Tropical (Rev. Biol. Trop.): Continuous publication, 01 January - 31 December 2022; 173–189 2215-2075 0034-7744 10.15517/rev.biol.trop..v70i1.2022 eng https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/rbt/article/view/47407/50374 https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/rbt/article/view/47407/50375 Copyright (c) 2022 Revista de Biología Tropical http://creativecommons.org/licenses/by/4.0 |
institution |
Universidad de Costa Rica |
collection |
Revista de Biología Tropical |
language |
eng |
format |
Online |
author |
Segura-Ulate, Ismael Bolívar-González, Alejandro Madrigal-Redondo, Germán Nuñez-Corrales, Santiago Gatica-Arias, Andrés |
spellingShingle |
Segura-Ulate, Ismael Bolívar-González, Alejandro Madrigal-Redondo, Germán Nuñez-Corrales, Santiago Gatica-Arias, Andrés Amplificación isotérmica mediada por bucle de transcripción inversa y protocolos alternativos para pruebas COVID-19 a gran escala y de bajo costo: lecciones de una economía emergente |
author_facet |
Segura-Ulate, Ismael Bolívar-González, Alejandro Madrigal-Redondo, Germán Nuñez-Corrales, Santiago Gatica-Arias, Andrés |
author_sort |
Segura-Ulate, Ismael |
description |
Introducción: la mayoría de los casos exitosos de mitigación y manejo de la pandemia de COVID-19 se han dado mediante pruebas basadas en la reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa (RT-qPCR por sus siglas en inglés). Sin embargo, muchas economías emergentes han tenido problemas con las demandas actuales de pruebas moleculares debido a limitaciones económicas, técnicas y tecnológicas. Objetivo: Definir un protocolo de diagnóstico potencial para aumentar la capacidad de prueba en las condiciones actuales y posteriores a la pandemia. Métodos: Revisamos la literatura, las patentes y las aplicaciones comerciales, en busca de alternativas. Resultados: Encontramos un buen potencial en muestras de saliva, inactivación viral y extracción rápida de ARN por calentamiento; el uso de una tecnología isotérmica como la amplificación isotérmica mediada por horquillas (LAMP, por sus siglas en inglés) y la visualización del resultado de la prueba a simple vista mediante colorimetría o turbidez en el tubo. Conclusiones: Las muestras de saliva con extracción rápida de ARN por calentamiento y LAMP colorimétrico son opciones prometedoras para países con limitaciones económicas y de infraestructura. |
title |
Amplificación isotérmica mediada por bucle de transcripción inversa y protocolos alternativos para pruebas COVID-19 a gran escala y de bajo costo: lecciones de una economía emergente |
title_short |
Amplificación isotérmica mediada por bucle de transcripción inversa y protocolos alternativos para pruebas COVID-19 a gran escala y de bajo costo: lecciones de una economía emergente |
title_full |
Amplificación isotérmica mediada por bucle de transcripción inversa y protocolos alternativos para pruebas COVID-19 a gran escala y de bajo costo: lecciones de una economía emergente |
title_fullStr |
Amplificación isotérmica mediada por bucle de transcripción inversa y protocolos alternativos para pruebas COVID-19 a gran escala y de bajo costo: lecciones de una economía emergente |
title_full_unstemmed |
Amplificación isotérmica mediada por bucle de transcripción inversa y protocolos alternativos para pruebas COVID-19 a gran escala y de bajo costo: lecciones de una economía emergente |
title_sort |
amplificación isotérmica mediada por bucle de transcripción inversa y protocolos alternativos para pruebas covid-19 a gran escala y de bajo costo: lecciones de una economía emergente |
title_alt |
Reverse-Transcription Loop-Mediated Isothermal Amplification and alternative protocols for lower cost, large-scale COVID-19 testing: lessons from an emerging economy |
publisher |
Universidad de Costa Rica |
publishDate |
2022 |
url |
https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/rbt/article/view/47407 |
work_keys_str_mv |
AT seguraulateismael reversetranscriptionloopmediatedisothermalamplificationandalternativeprotocolsforlowercostlargescalecovid19testinglessonsfromanemergingeconomy AT bolivargonzalezalejandro reversetranscriptionloopmediatedisothermalamplificationandalternativeprotocolsforlowercostlargescalecovid19testinglessonsfromanemergingeconomy AT madrigalredondogerman reversetranscriptionloopmediatedisothermalamplificationandalternativeprotocolsforlowercostlargescalecovid19testinglessonsfromanemergingeconomy AT nunezcorralessantiago reversetranscriptionloopmediatedisothermalamplificationandalternativeprotocolsforlowercostlargescalecovid19testinglessonsfromanemergingeconomy AT gaticaariasandres reversetranscriptionloopmediatedisothermalamplificationandalternativeprotocolsforlowercostlargescalecovid19testinglessonsfromanemergingeconomy AT seguraulateismael amplificacionisotermicamediadaporbucledetranscripcioninversayprotocolosalternativosparapruebascovid19agranescalaydebajocostoleccionesdeunaeconomiaemergente AT bolivargonzalezalejandro amplificacionisotermicamediadaporbucledetranscripcioninversayprotocolosalternativosparapruebascovid19agranescalaydebajocostoleccionesdeunaeconomiaemergente AT madrigalredondogerman amplificacionisotermicamediadaporbucledetranscripcioninversayprotocolosalternativosparapruebascovid19agranescalaydebajocostoleccionesdeunaeconomiaemergente AT nunezcorralessantiago amplificacionisotermicamediadaporbucledetranscripcioninversayprotocolosalternativosparapruebascovid19agranescalaydebajocostoleccionesdeunaeconomiaemergente AT gaticaariasandres amplificacionisotermicamediadaporbucledetranscripcioninversayprotocolosalternativosparapruebascovid19agranescalaydebajocostoleccionesdeunaeconomiaemergente |
_version_ |
1810115317295218688 |