Genética de poblaciones del pez Brycon henni (Characiformes: Bryconidae) utilizando loci microsatélites polimórficos especie-específicos

Genética de poblaciones del pez Brycon henni (Characiformes: Bryconidae) utilizando loci microsatélites polimórficos especie-específicos

Introducción: El pez de agua dulce Brycon henni (Characiformes: Bryconidae) es una especie endémica de Colombia que actualmente está catalogada como de “menor preocupación” por la Unión Internacional para la Conservación de la Naturaleza (UICN). Objetivo: Desarrollar marcadores microsatélites para e...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autores principales: Landínez-García, Ricardo M., Márquez, Edna J.
Formato: Online
Idioma:eng
Publicado: Universidad de Costa Rica 2020
Acceso en línea:https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/rbt/article/view/38405
id RBT38405
record_format ojs
institution Universidad de Costa Rica
collection Revista de Biología Tropical
language eng
format Online
author Landínez-García, Ricardo M.
Márquez, Edna J.
spellingShingle Landínez-García, Ricardo M.
Márquez, Edna J.
Genética de poblaciones del pez Brycon henni (Characiformes: Bryconidae) utilizando loci microsatélites polimórficos especie-específicos
author_facet Landínez-García, Ricardo M.
Márquez, Edna J.
author_sort Landínez-García, Ricardo M.
description Introducción: El pez de agua dulce Brycon henni (Characiformes: Bryconidae) es una especie endémica de Colombia que actualmente está catalogada como de “menor preocupación” por la Unión Internacional para la Conservación de la Naturaleza (UICN). Objetivo: Desarrollar marcadores microsatélites para estudiar la genética poblacional de Brycon henni. Métodos: Usando una biblioteca genómica de secuenciación de baja cobertura, este estudio desarrolló el primer grupo de loci microsatélites para el estudio de la genética poblacional de esta especie neotropical. Estos loci fueron usados para evaluar la diversidad genética y estructura de B. henni en tres sitios de la cuenca Magdalena-Cauca (Colombia). Resultados: Un grupo de 21 loci polimórficos tipo microsatélite fueron altamente informativos y revelaron que B. henni exhibe diversidad genética (5.143-5.619 alelos/locus, heterocigosidad observada y esperada = 0.461-0.645 y 0.604-0.662, respectivamente) y se encuentra genéticamente estructurado entre dos tributarios del río Cauca separados únicamente por 30 km (FꞌST = 0.093, Jost’s DEST = 0.311, P < 0.001), un resultado que indica que puede existir aislamiento reproductivo entre dichos grupos. Conclusiones: Reportamos un grupo de 21 loci polimórficos tipo microsatélite que permitieron la detección de la estructura genética a escala local y regional. Esta estructura genética poblacional, concordante con lo que se reporta para otros ocho congéneres, es relevante al determinar la categorización de riesgo de B. henni, así como los programas de manejo, conservación y repoblamiento para esta especie.
title Genética de poblaciones del pez Brycon henni (Characiformes: Bryconidae) utilizando loci microsatélites polimórficos especie-específicos
title_short Genética de poblaciones del pez Brycon henni (Characiformes: Bryconidae) utilizando loci microsatélites polimórficos especie-específicos
title_full Genética de poblaciones del pez Brycon henni (Characiformes: Bryconidae) utilizando loci microsatélites polimórficos especie-específicos
title_fullStr Genética de poblaciones del pez Brycon henni (Characiformes: Bryconidae) utilizando loci microsatélites polimórficos especie-específicos
title_full_unstemmed Genética de poblaciones del pez Brycon henni (Characiformes: Bryconidae) utilizando loci microsatélites polimórficos especie-específicos
title_sort genética de poblaciones del pez brycon henni (characiformes: bryconidae) utilizando loci microsatélites polimórficos especie-específicos
title_alt Population genetics of the fish Brycon henni (Characiformes: Bryconidae) using species-specific polymorphic microsatellite loci
publisher Universidad de Costa Rica
publishDate 2020
url https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/rbt/article/view/38405
work_keys_str_mv AT landinezgarciaricardom populationgeneticsofthefishbryconhennicharaciformesbryconidaeusingspeciesspecificpolymorphicmicrosatelliteloci
AT marquezednaj populationgeneticsofthefishbryconhennicharaciformesbryconidaeusingspeciesspecificpolymorphicmicrosatelliteloci
AT landinezgarciaricardom geneticadepoblacionesdelpezbryconhennicharaciformesbryconidaeutilizandolocimicrosatelitespolimorficosespecieespecificos
AT marquezednaj geneticadepoblacionesdelpezbryconhennicharaciformesbryconidaeutilizandolocimicrosatelitespolimorficosespecieespecificos
_version_ 1810115270770950144
spelling RBT384052023-11-09T18:20:57Z Population genetics of the fish Brycon henni (Characiformes: Bryconidae) using species-specific polymorphic microsatellite loci Genética de poblaciones del pez Brycon henni (Characiformes: Bryconidae) utilizando loci microsatélites polimórficos especie-específicos Landínez-García, Ricardo M. Márquez, Edna J. next-generation sequencing molecular markers genetic structure genetic diversity Neotropical fish sabaleta conservation secuenciación de próxima generación marcadores moleculares estructura genética diversidad genética peces neotropicales sabaleta conservación Introduction: The freshwater fish Brycon henni (Characiformes: Bryconidae) is endemic to Colombia and currently considered as a “least concern” species according to the International Union for Conservation of Nature (IUCN). Objective: To develop microsatellite markers to examine population genetics in B. henni. Methods: Using a low-coverage sequencing genomic library, this study developed the first set of microsatellite loci to study the population genetics of this Neotropical species. These loci were used to evaluate the genetic diversity and structure of B. henni from three sites of the Magdalena-Cauca Basin (Colombia). Results: A set of 21 polymorphic microsatellite loci was highly informative and revealed that B. henni exhibits genetic diversity (5.143-5.619 alleles/locus, observed and expected heterozygosity = 0.461-0.645 and 0.604-0.662, respectively) and is evenly genetically structured between two tributaries of the Cauca River separated by only 30 km (FꞌST = 0.093, Jost’s DEST = 0.311, P < 0.001) a finding that indicates these may be reproductively isolated groups. Conclusions: We reported a set of 21 polymorphic microsatellite loci that allowed the detection of genetic structure at local and regional scales. This population genetic structure, concordant with that found in eight congeners, is relevant when determining the risk categorization of B. henni, as well as management, conservation, and restocking programs for this species. Introducción: El pez de agua dulce Brycon henni (Characiformes: Bryconidae) es una especie endémica de Colombia que actualmente está catalogada como de “menor preocupación” por la Unión Internacional para la Conservación de la Naturaleza (UICN). Objetivo: Desarrollar marcadores microsatélites para estudiar la genética poblacional de Brycon henni. Métodos: Usando una biblioteca genómica de secuenciación de baja cobertura, este estudio desarrolló el primer grupo de loci microsatélites para el estudio de la genética poblacional de esta especie neotropical. Estos loci fueron usados para evaluar la diversidad genética y estructura de B. henni en tres sitios de la cuenca Magdalena-Cauca (Colombia). Resultados: Un grupo de 21 loci polimórficos tipo microsatélite fueron altamente informativos y revelaron que B. henni exhibe diversidad genética (5.143-5.619 alelos/locus, heterocigosidad observada y esperada = 0.461-0.645 y 0.604-0.662, respectivamente) y se encuentra genéticamente estructurado entre dos tributarios del río Cauca separados únicamente por 30 km (FꞌST = 0.093, Jost’s DEST = 0.311, P < 0.001), un resultado que indica que puede existir aislamiento reproductivo entre dichos grupos. Conclusiones: Reportamos un grupo de 21 loci polimórficos tipo microsatélite que permitieron la detección de la estructura genética a escala local y regional. Esta estructura genética poblacional, concordante con lo que se reporta para otros ocho congéneres, es relevante al determinar la categorización de riesgo de B. henni, así como los programas de manejo, conservación y repoblamiento para esta especie. Universidad de Costa Rica 2020-09-30 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion Article application/pdf text/html https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/rbt/article/view/38405 10.15517/rbt.v68i3.38405 Revista de Biología Tropical; Vol. 68 No. 3 (2020): Revista de Biología Tropical (Int. J. Trop. Biol.): Continuous publication, July - September 2020; 847–861 Revista de Biología Tropical; Vol. 68 Núm. 3 (2020): Revista de Biología Tropical (Int. J. Trop. Biol.): Publicación continua, Julio - Setiembre 2020; 847–861 Revista Biología Tropical; Vol. 68 N.º 3 (2020): Revista de Biología Tropical (Int. J. Trop. Biol.): Continuous publication, July - September 2020; 847–861 2215-2075 0034-7744 10.15517/rbt.v68i3 eng https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/rbt/article/view/38405/42468 https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/rbt/article/view/38405/42469 Copyright (c) 2020 Edna Judith Márquez, Ricardo Marcel Landínez-García http://creativecommons.org/licenses/by/4.0

Ejemplares similares