Rastreo genético de camarón de cultivo (Decapoda, Penaeidae) en poblaciones silvestres de la región principal de cultivo de México
La liberación o escape de lotes de cultivo pueden impactar la composición y variabilidad genética de las poblaciones silvestres, dando lugar a diversos problemas que pueden comprometer la eficacia biológica a largo plazo. Por lo tanto, es relevante determinar si las poblaciones de cultivo se encuent...
Autores principales: | , , , |
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Formato: | Online |
Idioma: | eng |
Publicado: |
Universidad de Costa Rica
2018
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Acceso en línea: | https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/rbt/article/view/27112 |
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Perez-Enriquez, Ricardo Medina-Espinoza, Jesús A. Max-Aguilar, Adriana Saucedo-Barrón, César J. |
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Perez-Enriquez, Ricardo Medina-Espinoza, Jesús A. Max-Aguilar, Adriana Saucedo-Barrón, César J. Rastreo genético de camarón de cultivo (Decapoda, Penaeidae) en poblaciones silvestres de la región principal de cultivo de México |
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La liberación o escape de lotes de cultivo pueden impactar la composición y variabilidad genética de las poblaciones silvestres, dando lugar a diversos problemas que pueden comprometer la eficacia biológica a largo plazo. Por lo tanto, es relevante determinar si las poblaciones de cultivo se encuentran actualmente interactuando con las poblaciones silvestres. El cultivo de camarón es una actividad de acuicultura que tiene lugar a lo largo de la costa del Pacífico tropical de América, y es la más importante en el noroeste de México. En este estudio, el camarón blanco Litopenaeus vannamei silvestre y de cultivo proveniente del Estado de Sinaloa, México, fueron evaluados genéticamente para determinar los niveles de mezcla. Se desarrolló un lote de 14 marcadores microsatélites nuevos (número de alelos promedio por locus de 11.8 y heterocigosidad esperada promedio de 0.836), mediante secuenciación de nueva generación, para la caracterización de las muestras. El muestreo consistió en camarón silvestre recolectado durante tres años (2002, 2012 y 2013) y dos lotes de unidades productoras de larva del 2007. No se observaron diferencias significativas entre años en las muestras silvestres, pero el análisis de agrupamiento indicó que los lotes de las unidades productoras de larva fueron distintos a los ejemplares silvestres. Desviaciones del equilibrio de Hardy-Weinberg y los análisis de asignación de genotipos indicaron que una fracción de cada una de las muestras silvestres podría contener individuos originados del larvicultivo. Se discuten las razones que explican la liberación de camarón de cultivo intencional y no intencional al medio silvestre. Aun cuando la fracción estimada de individuos de origen de cultivo en las muestras silvestres más recientes (2012-2013; promedio = 7.1 %) se considera de bajo riesgo, se dan recomendaciones de manejo para unidades de larvicultura y granjas de cultivo. |
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Genetic tracing of farmed shrimp (Decapoda, Penaeidae) in wild populations from a main aquaculture region in Mexico |
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RBT271122022-06-09T18:12:57Z Genetic tracing of farmed shrimp (Decapoda, Penaeidae) in wild populations from a main aquaculture region in Mexico Rastreo genético de camarón de cultivo (Decapoda, Penaeidae) en poblaciones silvestres de la región principal de cultivo de México Perez-Enriquez, Ricardo Medina-Espinoza, Jesús A. Max-Aguilar, Adriana Saucedo-Barrón, César J. genetic diversity genetic impact microsatellites release Litopenaeus vannamei diversidad genética impacto genético microsatélites repoblación Litopenaeus vannamei Release or escapes of aquaculture organisms may impact the genetic composition and variability of wild populations, leading to diverse issues that may compromise long-term wild stock fitness. Therefore, it is relevant to determine if farmed stocks are currently interacting with wild populations. Shrimp farming is an aquaculture activity taking place along the tropical Pacific coast of the Americas, and represents the most important culture bussiness of Northwestern Mexico. In this study, wild and farmed whiteleg shrimp Litopenaeus vannamei from the State of Sinaloa were genetically evaluated to determine admixture levels. A newly developed set of 14 microsatellite markers (mean number of alleles per locus 11.8, and 0.836 expected heterozygosity) was obtained by Next Generation Sequencing to characterize samples. Sampling consisted of 32 wild shrimps collected during three years (2002, 2012, and 2013) and three different sites, and two hatchery stocks from 2007. No significant differences were observed among years in the wild samples, but cluster analyses showed that hatchery-produced individuals were different from wild specimens. Deviations from Hardy-Weinberg Equilibrium and genotype assignment tests indicated that a fraction from each sample could contain individuals from hatchery origin. Even though the estimated fraction of escaped farmed individuals in the most recent samples (2012-2013; mean = 7.1 %) is considered of low genetic risk, management recommendations for hatcheries and farms were provided. Besides, the reasons that explain the intended and unintended farmed shrimp release into the wild were discussed. La liberación o escape de lotes de cultivo pueden impactar la composición y variabilidad genética de las poblaciones silvestres, dando lugar a diversos problemas que pueden comprometer la eficacia biológica a largo plazo. Por lo tanto, es relevante determinar si las poblaciones de cultivo se encuentran actualmente interactuando con las poblaciones silvestres. El cultivo de camarón es una actividad de acuicultura que tiene lugar a lo largo de la costa del Pacífico tropical de América, y es la más importante en el noroeste de México. En este estudio, el camarón blanco Litopenaeus vannamei silvestre y de cultivo proveniente del Estado de Sinaloa, México, fueron evaluados genéticamente para determinar los niveles de mezcla. Se desarrolló un lote de 14 marcadores microsatélites nuevos (número de alelos promedio por locus de 11.8 y heterocigosidad esperada promedio de 0.836), mediante secuenciación de nueva generación, para la caracterización de las muestras. El muestreo consistió en camarón silvestre recolectado durante tres años (2002, 2012 y 2013) y dos lotes de unidades productoras de larva del 2007. No se observaron diferencias significativas entre años en las muestras silvestres, pero el análisis de agrupamiento indicó que los lotes de las unidades productoras de larva fueron distintos a los ejemplares silvestres. Desviaciones del equilibrio de Hardy-Weinberg y los análisis de asignación de genotipos indicaron que una fracción de cada una de las muestras silvestres podría contener individuos originados del larvicultivo. Se discuten las razones que explican la liberación de camarón de cultivo intencional y no intencional al medio silvestre. Aun cuando la fracción estimada de individuos de origen de cultivo en las muestras silvestres más recientes (2012-2013; promedio = 7.1 %) se considera de bajo riesgo, se dan recomendaciones de manejo para unidades de larvicultura y granjas de cultivo. Universidad de Costa Rica 2018-03-01 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion Article application/pdf text/html application/pdf https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/rbt/article/view/27112 10.15517/rbt.v66i1.27112 Revista de Biología Tropical; Vol. 66 No. 1 (2018): Volume 66 – Regular number 1 – March 2018; 381–393 Revista de Biología Tropical; Vol. 66 Núm. 1 (2018): Volumen 66 – Número regular 1 – Marzo 2018; 381–393 Revista Biología Tropical; Vol. 66 N.º 1 (2018): Volume 66 – Regular number 1 – March 2018; 381–393 2215-2075 0034-7744 10.15517/rbt.v66i1 eng https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/rbt/article/view/27112/31906 https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/rbt/article/view/27112/31907 https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/rbt/article/view/27112/35312 Copyright (c) 2018 Revista de Biología Tropical http://creativecommons.org/licenses/by/4.0 |