Identificación molecular de aislamientos de Fusarium asociados a maracuyá en el Valle del Cauca, Colombia

Identificación molecular de aislamientos de Fusarium asociados a maracuyá en el Valle del Cauca, Colombia

La producción de maracuyá en Colombia ha mostrado grandes avances; sin embargo, las enfermedades continúan siendo un factor limitante en la producción del mismo. Entre los agentes patógenos que dificultan el establecimiento y desarrollo del cultivo, se encuentran algunas especies del género Fusarium...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autores principales: Henao-Henao, Edwin David, Hernandez-Medina, Carlos Alberto, Salazar-González, Claudia, Velasco-Belalcazar, Martha Lucia, Gómez-López, Eyder Daniel
Formato: Online
Idioma:spa
Publicado: Universidad de Costa Rica 2018
Acceso en línea:https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/agromeso/article/view/27114
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description La producción de maracuyá en Colombia ha mostrado grandes avances; sin embargo, las enfermedades continúan siendo un factor limitante en la producción del mismo. Entre los agentes patógenos que dificultan el establecimiento y desarrollo del cultivo, se encuentran algunas especies del género Fusarium, consideradas de importancia económica por las pérdidas que generan. El objetivo de este trabajo fue identificar molecularmente las poblaciones de Fusarium presentes en maracuyá (Passiflora edulis). Entre enero y diciembre de 2015 se realizó el aislamiento de 35 muestras de diferentes órganos afectados de la planta y provenientes de localidades ubicadas en cinco municipios del Valle del Cauca, Colombia. Se seleccionaron y purificaron ocho aislamientos pertenecientes al género de interés para realizar la extracción de ADN y amplificación de la región TEF 1 alpha. Los productos de PCR fueron secuenciados y comparados con las bases de datos del NCBI y del Fusarium ID. Los aislamientos pertenecían a: Fusarium incarnatum, Fusarium proliferatum y Fusarium solani, la primera especie fue la de mayor ocurrencia en las muestras evaluadas. En el análisis de las relaciones filogenéticas realizado mediante el programa MEGA 6, se usó el coeficiente de similitud del vecino más cercano, lo que permitió observar variabilidad entre los aislamientos evaluados.
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spelling AGROMESO271142023-06-16T13:47:59Z Molecular identification of Fusarium isolates associated with passion fruit in five locations from Valle del Cauca, Colombia. Identificación molecular de aislamientos de Fusarium asociados a maracuyá en el Valle del Cauca, Colombia Henao-Henao, Edwin David Hernandez-Medina, Carlos Alberto Salazar-González, Claudia Velasco-Belalcazar, Martha Lucia Gómez-López, Eyder Daniel fusariosis Passiflora edulis fungal diseases genetic variation. fusariosis Passiflora edulis enfermedades fungosas variación genética. Fitopatologia Biotecnologia Microbiologia The passion fruit’s production in Colombia has shown great advances; however, phytosanitary diseases remain as issues in passion fruit production. This includes the pathogens that hinder the establishment and development of the crop, such as some species of the genus Fusarium, pathogen considered as an important one because of the economic losses that it generates. The objective of this work was to molecularly identificate the populations of Fusarium associated with passion fruit (Passiflora edulis). Between January and December 2015, an isolation of 35 samples based on different affected organs of the plant and from localities found in five municipalities was performed in Valle del Cauca, Colombia. Eight isolates were selected and purified in order to perform their DNA’s extraction and also an amplification of region TEF 1 alpha. The PCR products were sequenced and compared with the NCBI database and Fusarium ID. The results obtained by sequencing showed that the isolates belong to Fusarium incarnatum, Fusarium solani, and Fusarium proliferatum, the first species had a mayor occurrence in the tested samples. The analysis of phylogenetic relationships was achieved by using the 6 MEGA program, and by using the similarity coefficient nearest neighbor, which allowed to observe the variability among the evaluated isolates. La producción de maracuyá en Colombia ha mostrado grandes avances; sin embargo, las enfermedades continúan siendo un factor limitante en la producción del mismo. Entre los agentes patógenos que dificultan el establecimiento y desarrollo del cultivo, se encuentran algunas especies del género Fusarium, consideradas de importancia económica por las pérdidas que generan. El objetivo de este trabajo fue identificar molecularmente las poblaciones de Fusarium presentes en maracuyá (Passiflora edulis). Entre enero y diciembre de 2015 se realizó el aislamiento de 35 muestras de diferentes órganos afectados de la planta y provenientes de localidades ubicadas en cinco municipios del Valle del Cauca, Colombia. Se seleccionaron y purificaron ocho aislamientos pertenecientes al género de interés para realizar la extracción de ADN y amplificación de la región TEF 1 alpha. Los productos de PCR fueron secuenciados y comparados con las bases de datos del NCBI y del Fusarium ID. Los aislamientos pertenecían a: Fusarium incarnatum, Fusarium proliferatum y Fusarium solani, la primera especie fue la de mayor ocurrencia en las muestras evaluadas. En el análisis de las relaciones filogenéticas realizado mediante el programa MEGA 6, se usó el coeficiente de similitud del vecino más cercano, lo que permitió observar variabilidad entre los aislamientos evaluados. Universidad de Costa Rica 2018-01-01 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion Article Extracción de ADN application/pdf text/html application/epub+zip image/png image/jpeg application/pdf https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/agromeso/article/view/27114 10.15517/ma.v29i1.27114 Agronomía Mesoamericana; 2018: Agronomía Mesoamericana: Vol. 29, Issue 1 (January-April); 53-61 Agronomía Mesoamericana; 2018: Agronomía Mesoamericana: Vol. 29, Nº 1 (Enero-abril); 53-61 Agronomía Mesoamericana; 2018: Agronomía Mesoamericana: Vol. 29, Issue 1 (January-April); 53-61 2215-3608 1021-7444 spa https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/agromeso/article/view/27114/31462 https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/agromeso/article/view/27114/31535 https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/agromeso/article/view/27114/32045 https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/agromeso/article/view/27114/35313 https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/agromeso/article/view/27114/35314 https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/agromeso/article/view/27114/35315

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