Caracterización molecular de maíces locales de la Reserva de la Biosfera La Sepultura, México.
El objetivo de este trabajo fue la caracterización molecular y filogenética de poblaciones de maíces locales de la Reserva de la Biosfera La Sepultura (REBISE), México. Se colectaron diecinueve poblaciones de maíz en nueve comunidades de la REBISE durante el ciclo agrícola 2012-2013. Se incluyeron a...
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Publicado: |
Universidad de Costa Rica
2016
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Acceso en línea: | https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/agromeso/article/view/21612 |
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Hernández-Ramos, Manuel Antonio Rodríguez-Larramendi, Luis A. Guevara-Hernández, Francisco Rosales-Esquianca, María de los Ángeles Pinto-Ruiz, René Ortiz-Pérez, Rodobaldo Caracterización molecular de maíces locales de la Reserva de la Biosfera La Sepultura, México. |
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El objetivo de este trabajo fue la caracterización molecular y filogenética de poblaciones de maíces locales de la Reserva de la Biosfera La Sepultura (REBISE), México. Se colectaron diecinueve poblaciones de maíz en nueve comunidades de la REBISE durante el ciclo agrícola 2012-2013. Se incluyeron además, dos variedades comerciales (VS-536 y VS-424), un híbrido comercial (H-MX3), un maíz recientemente introducido (Costeño), dos materiales de las razas Cónico chalqueño y elotes cónicos, y un teocintle (Zea mays ssp. Mexicana). En total fueron 26 muestras diferentes. La caracterización se realizó mediante RCP con marcadores inter-microsatélites (ISSR). Se ampli caron 113 fragmentos, en un rango de 150 a 2200 pb de los cuales 85,8% fueron polimórficos. Las secuencias “AG”, “AC” y “GAA” tuvieron mayor número de bandas amplificadas y mayor polimorfismo. Los cebadores UBC834, I9 y UBC868 fueron los que mejor ampli caron. Las similitudes dentro de las bandas polimórficas pueden deberse a su igualdad como variedades, razas, especie, o al efecto de su polinización cruzada. El dendograma obtenido mostró una correlación cofenética relativamente baja (r=0,721) con un grado de confiabilidad bajo; no obstante, se integran claramente cuatro grupos principales. El primero se denominó maíces de Valles Altos, caracterizada por la raza cónico Chalqueño y Elotes cónicos; el segundo se identificó por tener como ancestro común el Teocintle; el tercero contuvo el híbrido comercial H-MX3; y el cuarto comprendió los maíces locales de la REBISE y las variedades comerciales (Vs-536 y Vs-424). |
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Molecular characterization of local maize varieties from the Biosphere Reserve La Sepultura, Mexico. |
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AGROMESO216122023-06-16T13:48:50Z Molecular characterization of local maize varieties from the Biosphere Reserve La Sepultura, Mexico. Caracterización molecular de maíces locales de la Reserva de la Biosfera La Sepultura, México. Hernández-Ramos, Manuel Antonio Rodríguez-Larramendi, Luis A. Guevara-Hernández, Francisco Rosales-Esquianca, María de los Ángeles Pinto-Ruiz, René Ortiz-Pérez, Rodobaldo protected areas ISSR polymorphism genetic variability. áreas protegidas ISSR polimorfismo variabilidad genética. The objective of this research was the molecular and phylogenetic characterization of local maize populations of the La Sepultura Biosphere Reserve (REBISE), Mexico. In nine communities from the REBISE, Mexico, nineteen populations of local maize were sampled during 2012-2013. Two improved commercial varieties (Vs-536 and V-424), a commercial hybrid (H-MX3), a local corn (Coastal) recently introduced in the REBISE, two local materials from the state of Tlaxcala, Mexico; both from Chalqueño race and conical Elotes (young corns) and a teosinte (Zea mays ssp. Mexicana) were included. They totaled twenty six different samples. The characterization was done with the PCR technique and inter-type microsatellite genetic markers. In total 113, fragments were ampli ed and that ranged from 150-2200 bp, of which 85,8% were polymorphic. Sequences “AG”, “AC” and “GAA” showed a greater number of ampli ed bands and higher polymorphism. The primers comprised of UBC834, I9 and UBC868 ampli ed the best. The similarities found within the polymorphic bands may be due to their equality such as varieties, races, species or genetic combination effect, a result of their cross- pollination. The dendrogram obtained showed a relatively low cophenetic correlation (r= 0,721), with a low degree of reliability, however four major groups of varieties are clearly conformed. The first was named Valles Altos Corns, integrated by the conical Chalqueño and the conical Elotes races; the second is identified as having a common ancestor with Teocintle; the third is an improved hybrid by the H-MX3; and the fourth includes the REBISE local maize varieties and other commercial varieties (Vs-536 y Vs-424). El objetivo de este trabajo fue la caracterización molecular y filogenética de poblaciones de maíces locales de la Reserva de la Biosfera La Sepultura (REBISE), México. Se colectaron diecinueve poblaciones de maíz en nueve comunidades de la REBISE durante el ciclo agrícola 2012-2013. Se incluyeron además, dos variedades comerciales (VS-536 y VS-424), un híbrido comercial (H-MX3), un maíz recientemente introducido (Costeño), dos materiales de las razas Cónico chalqueño y elotes cónicos, y un teocintle (Zea mays ssp. Mexicana). En total fueron 26 muestras diferentes. La caracterización se realizó mediante RCP con marcadores inter-microsatélites (ISSR). Se ampli caron 113 fragmentos, en un rango de 150 a 2200 pb de los cuales 85,8% fueron polimórficos. Las secuencias “AG”, “AC” y “GAA” tuvieron mayor número de bandas amplificadas y mayor polimorfismo. Los cebadores UBC834, I9 y UBC868 fueron los que mejor ampli caron. Las similitudes dentro de las bandas polimórficas pueden deberse a su igualdad como variedades, razas, especie, o al efecto de su polinización cruzada. El dendograma obtenido mostró una correlación cofenética relativamente baja (r=0,721) con un grado de confiabilidad bajo; no obstante, se integran claramente cuatro grupos principales. El primero se denominó maíces de Valles Altos, caracterizada por la raza cónico Chalqueño y Elotes cónicos; el segundo se identificó por tener como ancestro común el Teocintle; el tercero contuvo el híbrido comercial H-MX3; y el cuarto comprendió los maíces locales de la REBISE y las variedades comerciales (Vs-536 y Vs-424). Universidad de Costa Rica 2016-12-12 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion Article application/pdf application/octet-stream text/html https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/agromeso/article/view/21612 10.15517/am.v28i1.21612 Agronomía Mesoamericana; 2017: Agronomía Mesoamericana: Vol. 28, Issue 1 (January-April); 69-83 Agronomía Mesoamericana; 2017: Agronomía Mesoamericana: Vol. 28, Nº 1 (Enero-abril); 69-83 Agronomía Mesoamericana; 2017: Agronomía Mesoamericana: Vol. 28, Issue 1 (January-April); 69-83 2215-3608 1021-7444 spa https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/agromeso/article/view/21612/27234 https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/agromeso/article/view/21612/28056 https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/agromeso/article/view/21612/28071 |