Variabilidad y diferenciación genética en cuatro poblaciones de la planta medicinal Psychotria acuminata en Costa Rica
Un total de 51 accesiones de Psychotria acuminata, provenientes de 4 poblaciones en Costa Rica, fueron evaluadas con los marcadores moleculares RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) e ISSR (Inter-Simple Sequence Repeat DNA). Con el uso de 16 decámeros se obtuvo 70 loci polimórficos y con 3 ISSRs 1...
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Universidad de Costa Rica
2003
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AGROCOST613822024-08-30T17:48:02Z Genetic diversity and differentiation of four populations of the medicinal plant Psychotria acuminata in Costa Rica Variabilidad y diferenciación genética en cuatro poblaciones de la planta medicinal Psychotria acuminata en Costa Rica Lara, Alfonso Valverde, Roberto Rocha, Oscar Gómez, Luis Psychotria acuminata medicinal plant genetic diversity RAPD ISSR Psychotria acuminata planta medicinal diversidad genética RAPD ISSR Fifty-one Psychotria acuminata accessions from 4 populations in Costa Rica were evaluated for genetic diversity using random amplified polymorphic DNA (RAPD) primers and inter-simple sequence repeat DNA (ISSR) primers. With the use of 16 10-mer primers, 70 polymorphic DNA loci were produced. On the other hand, with the 3 different ISSR primers, 15 polymorphic loci were generated. Both primer types were able to determine the genetic diversity among the 4 populations. Dendrograms based on the genetic distances among the 4 populations did not show similarities between RAPDs and ISSRs. However, both methods showed high genetic diversity among populations based on their Gst (0.292 and 0.313, respectively). Those high levels of genetic diversity, among the 4 populations, could be explained neither by the climate factor (r2=-0.302, P-value 0.560) nor by the geographic distance (r2=-0183, P-value 0.768). From present data it is concluded the P. acuminata populations evaluated here show an important level of genotype differentiation. As a consequence, it may be possible to utilize the genetic diversity of the species not only for biodiversity conservation programs, but also for a better use of their phytochemical resources. Un total de 51 accesiones de Psychotria acuminata, provenientes de 4 poblaciones en Costa Rica, fueron evaluadas con los marcadores moleculares RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) e ISSR (Inter-Simple Sequence Repeat DNA). Con el uso de 16 decámeros se obtuvo 70 loci polimórficos y con 3 ISSRs 15 loci polimórficos. Ambos tipos de imprimador fueron capaces de determinar la diversidad genética entre las 4 poblaciones. Los dendrogramas basados en la distancia genética entre las poblaciones no mostraron similitud entre los RAPDs y los ISSRs; sin embargo, ambos métodos revelaron una alta variabilidad genética entre las poblaciones (Gst de 0,292 y 0,313 para los RAPDs y los ISSRs, respectivamente). Estos niveles altos de diversidad genética, entre las 4 poblaciones, no pudieron ser explicados por los factores climáticos (r2=-0,302, P=0,560) ni por las distancias geográficas (r2=-0,183, P=0,768). Con los resultados obtenidos se concluye que las poblaciones de P. acuminata evaluadas presentan un importante nivel de diferenciación genotípica. Como consecuencia, sería posible utilizar la diversidad genética de esta especie no solo en programas de conservación de la biodiversidad, sino también para un mejor uso de sus recursos fitoquímicos. Universidad de Costa Rica 2003-07-01 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion Article Artículo application/pdf https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/agrocost/article/view/61382 10.15517/rac.v27i2.61382 Agronomía Costarricense; Agronomía Costarricense: Vol. 27, Issue 2 (July - December); 29-42 Agronomía Costarricense; Agronomía Costarricense: Vol. 27, Nº 2 (Julio -Diciembre); 29-42 2215-2202 0377-9424 10.15517/rac.v27i2 spa https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/agrocost/article/view/61382/60926 Derechos de autor 2024 Agronomía Costarricense https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0 |
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Un total de 51 accesiones de Psychotria acuminata, provenientes de 4 poblaciones en Costa Rica, fueron evaluadas con los marcadores moleculares RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) e ISSR (Inter-Simple Sequence Repeat DNA). Con el uso de 16 decámeros se obtuvo 70 loci polimórficos y con 3 ISSRs 15 loci polimórficos. Ambos tipos de imprimador fueron capaces de determinar la diversidad genética entre las 4 poblaciones. Los dendrogramas basados en la distancia genética entre las poblaciones no mostraron similitud entre los RAPDs y los ISSRs; sin embargo, ambos métodos revelaron una alta variabilidad genética entre las poblaciones (Gst de 0,292 y 0,313 para los RAPDs y los ISSRs, respectivamente). Estos niveles altos de diversidad genética, entre las 4 poblaciones, no pudieron ser explicados por los factores climáticos (r2=-0,302, P=0,560) ni por las distancias geográficas (r2=-0,183, P=0,768). Con los resultados obtenidos se concluye que las poblaciones de P. acuminata evaluadas presentan un importante nivel de diferenciación genotípica. Como consecuencia, sería posible utilizar la diversidad genética de esta especie no solo en programas de conservación de la biodiversidad, sino también para un mejor uso de sus recursos fitoquímicos. |
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