Asociación entre marcadores genéticos CAPN-1, CAST y características de crecimiento en ganado brahman en Costa Rica

El objetivo de este estudio fue evaluar la presencia de polimorfismos de nucleótido simple (SNP´s) en genes de μ-calpaína (CAPN-1) y calpastatina (CAST) asociados a atributos de terneza en carne bovina y relacionar la presencia de estos genes con las diferencias esperadas de progenie (DEP´s) para ca...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autores principales: Madrigal-Valverde, Mónica, Valverde, Anthony, Murillo, Olger, Montero, Wayner, Muñoz, Bryan
Formato: Online
Idioma:spa
Publicado: Universidad de Costa Rica 2018
Acceso en línea:https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/agrocost/article/view/33776
id AGROCOST33776
record_format ojs
institution Universidad Nacional de Costa Rica
collection Agronomia costarricense
language spa
format Online
author Madrigal-Valverde, Mónica
Valverde, Anthony
Murillo, Olger
Montero, Wayner
Muñoz, Bryan
spellingShingle Madrigal-Valverde, Mónica
Valverde, Anthony
Murillo, Olger
Montero, Wayner
Muñoz, Bryan
Asociación entre marcadores genéticos CAPN-1, CAST y características de crecimiento en ganado brahman en Costa Rica
author_facet Madrigal-Valverde, Mónica
Valverde, Anthony
Murillo, Olger
Montero, Wayner
Muñoz, Bryan
author_sort Madrigal-Valverde, Mónica
description El objetivo de este estudio fue evaluar la presencia de polimorfismos de nucleótido simple (SNP´s) en genes de μ-calpaína (CAPN-1) y calpastatina (CAST) asociados a atributos de terneza en carne bovina y relacionar la presencia de estos genes con las diferencias esperadas de progenie (DEP´s) para características de crecimiento. Se recolectaron muestras de sangre (n = 82) de machos reproductores Brahman de registro, pertenecientes a 7 haciendas, ubicadas en 4 regiones geográficas de Costa Rica. Todos los individuos se encontraban incluidos en el programa de mejoramiento genético de bovinos de carne, dirigido por la Corporación Ganadera (CORFOGA). Las muestras de sangre fueron analizadas en el laboratorio de biología molecular del Instituto Tecnológico de Costa Rica, Sede San Carlos. Se analizó la presencia de los SNP´s CAPN316, CAPN4751 (gen CAPN- 1) y CAST2959 (gen CAST). Se estimaron las frecuencias alélicas en CAPN316 para C (0,006), G (0,994) y genotipos CC (0,000), CG (0,013) y GG (0,987). El marcador CAPN4751 presentó frecuencias alélicas para C (0,165), T (0,835), así como frecuencias genotípicas de CC (0,025), CT (0,279) y TT (0,696). El polimorfismo de nucleótido simple CAST2959 presentó frecuencias alélicas para A (0,667), G (0,333), y genotípicas para AA (0,432), AG (0,469) y GG (0,099). Se observó una baja frecuencia del alelo favorable C del gen CAPN316, sin embargo, se observó una distribución de frecuencias alélicas más equilibrada en CAPN4751 y CAST2959. En el análisis de asociación entre SNP´s favorables y DEP´s, se encontraron asociaciones muy débiles o incluso ausencia de correlación.
title Asociación entre marcadores genéticos CAPN-1, CAST y características de crecimiento en ganado brahman en Costa Rica
title_short Asociación entre marcadores genéticos CAPN-1, CAST y características de crecimiento en ganado brahman en Costa Rica
title_full Asociación entre marcadores genéticos CAPN-1, CAST y características de crecimiento en ganado brahman en Costa Rica
title_fullStr Asociación entre marcadores genéticos CAPN-1, CAST y características de crecimiento en ganado brahman en Costa Rica
title_full_unstemmed Asociación entre marcadores genéticos CAPN-1, CAST y características de crecimiento en ganado brahman en Costa Rica
title_sort asociación entre marcadores genéticos capn-1, cast y características de crecimiento en ganado brahman en costa rica
title_alt Association between molecular genetics markers CAPN-1, CAST and growth traits in Brahman cattle in Costa Rica.
publisher Universidad de Costa Rica
publishDate 2018
url https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/agrocost/article/view/33776
work_keys_str_mv AT madrigalvalverdemonica associationbetweenmoleculargeneticsmarkerscapn1castandgrowthtraitsinbrahmancattleincostarica
AT valverdeanthony associationbetweenmoleculargeneticsmarkerscapn1castandgrowthtraitsinbrahmancattleincostarica
AT murilloolger associationbetweenmoleculargeneticsmarkerscapn1castandgrowthtraitsinbrahmancattleincostarica
AT monterowayner associationbetweenmoleculargeneticsmarkerscapn1castandgrowthtraitsinbrahmancattleincostarica
AT munozbryan associationbetweenmoleculargeneticsmarkerscapn1castandgrowthtraitsinbrahmancattleincostarica
AT madrigalvalverdemonica asociacionentremarcadoresgeneticoscapn1castycaracteristicasdecrecimientoenganadobrahmanencostarica
AT valverdeanthony asociacionentremarcadoresgeneticoscapn1castycaracteristicasdecrecimientoenganadobrahmanencostarica
AT murilloolger asociacionentremarcadoresgeneticoscapn1castycaracteristicasdecrecimientoenganadobrahmanencostarica
AT monterowayner asociacionentremarcadoresgeneticoscapn1castycaracteristicasdecrecimientoenganadobrahmanencostarica
AT munozbryan asociacionentremarcadoresgeneticoscapn1castycaracteristicasdecrecimientoenganadobrahmanencostarica
_version_ 1781380266685628416
spelling AGROCOST337762022-01-15T03:58:39Z Association between molecular genetics markers CAPN-1, CAST and growth traits in Brahman cattle in Costa Rica. Asociación entre marcadores genéticos CAPN-1, CAST y características de crecimiento en ganado brahman en Costa Rica Madrigal-Valverde, Mónica Valverde, Anthony Murillo, Olger Montero, Wayner Muñoz, Bryan The objective of this study was to evaluate the presence of single nucleotide polymorphisms (SNPs) in μ-calpaine (CAPN-1) and calpastatina (CAST) genes associated with beef tenderness, and related to the presence of these genes with the expected progeny differences (EPDs) for growth characteristics. The blood samples (n= 82) were collected from Brahman male̓s bulls registered belonging to 7 farms, located at 4 geographic regions of Costa Rica. All males were included in the breeding program for beef cattle, managed by Corporación Ganadera (CORFOGA). The blood samples were analyzed at the molecular biology laboratory of Technological Institute of Costa Rica, San Carlos Headquarters. The presence of SNPs CAPN316, CAPN4751 (CAPN-1 gene) and CAST2959 (CAST gene) were analyzed. The allele frequencies in CAPN316 were estimated for C (0.006), G (0.994) and for genotypes CC (0.000), CG (0.013) and GG (0.987). The genetic marker CAPN4751 showed allele frequencies for C (0.165), T (0.835), as well as genotype frequencies of CC (0.025), CT (0.279) and TT (0.666). The single-nucleotide polymorphisms CAST2959 showed allele frequencies for A (0.667), G (0.333), and genotypic for AA (0.432), AG (0.469) and GG (0.099). A low frequency in CAPN316 of favorable C allele was determined, however, a more equilibrated frequency in CAPN4751 and CATS2959 was observed. In the association analysis between favorable SNPs and EPDs, a weak association was found, or even lack of correlation. El objetivo de este estudio fue evaluar la presencia de polimorfismos de nucleótido simple (SNP´s) en genes de μ-calpaína (CAPN-1) y calpastatina (CAST) asociados a atributos de terneza en carne bovina y relacionar la presencia de estos genes con las diferencias esperadas de progenie (DEP´s) para características de crecimiento. Se recolectaron muestras de sangre (n = 82) de machos reproductores Brahman de registro, pertenecientes a 7 haciendas, ubicadas en 4 regiones geográficas de Costa Rica. Todos los individuos se encontraban incluidos en el programa de mejoramiento genético de bovinos de carne, dirigido por la Corporación Ganadera (CORFOGA). Las muestras de sangre fueron analizadas en el laboratorio de biología molecular del Instituto Tecnológico de Costa Rica, Sede San Carlos. Se analizó la presencia de los SNP´s CAPN316, CAPN4751 (gen CAPN- 1) y CAST2959 (gen CAST). Se estimaron las frecuencias alélicas en CAPN316 para C (0,006), G (0,994) y genotipos CC (0,000), CG (0,013) y GG (0,987). El marcador CAPN4751 presentó frecuencias alélicas para C (0,165), T (0,835), así como frecuencias genotípicas de CC (0,025), CT (0,279) y TT (0,696). El polimorfismo de nucleótido simple CAST2959 presentó frecuencias alélicas para A (0,667), G (0,333), y genotípicas para AA (0,432), AG (0,469) y GG (0,099). Se observó una baja frecuencia del alelo favorable C del gen CAPN316, sin embargo, se observó una distribución de frecuencias alélicas más equilibrada en CAPN4751 y CAST2959. En el análisis de asociación entre SNP´s favorables y DEP´s, se encontraron asociaciones muy débiles o incluso ausencia de correlación. Universidad de Costa Rica 2018-06-27 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion Article application/pdf text/html application/epub+zip https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/agrocost/article/view/33776 10.15517/rac.v42i2.33776 Agronomía Costarricense; 2018: Agronomía Costarricense: Vol. 42, Issue 2 Agronomía Costarricense; 2018: Agronomía Costarricense: Volumen 42, número 2 2215-2202 0377-9424 10.15517/rac.v42i2 spa https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/agrocost/article/view/33776/33207 https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/agrocost/article/view/33776/33235 https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/agrocost/article/view/33776/33565 Derechos de autor 2018 Agronomía Costarricense