Pruebas de identidad y paternidad en ganado brahman registrado de Costa Rica
En programas de evaluación genética es indispensable la correcta identificación de los individuos de la población y la certeza de sus relaciones de parentesco. El objetivo de este estudio fue implementar pruebas de identificación y verificación de paternidad mediante 18 marcadores microsatélite en g...
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Universidad de Costa Rica
2018
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Campos, Jorge Vargas, Bernardo Camacho, Jorge Cruz, Argerie |
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En programas de evaluación genética es indispensable la correcta identificación de los individuos de la población y la certeza de sus relaciones de parentesco. El objetivo de este estudio fue implementar pruebas de identificación y verificación de paternidad mediante 18 marcadores microsatélite en ganado registrado de raza Brahman de Costa Rica. Inicialmente, se calcularon parámetros genéticos poblacionales a partir del análisis de 950 muestras de ADN (7 sementales, 788 vacas y 155 crías) colectadas durante los años 2015/2016, procedentes de 13 hatos de ganado registrado. Los promedios de heterocigosidad observada y esperada fueron de 0,67 y 0,70, respectivamente. El índice de fijación fue de 4%, con desviaciones significativas del equilibrio Hardy-Weinberg (EHW) en 9 de los 18 loci. Todos los marcadores, excepto ETH225, presentaron contenido de información polimórfica mayor a 0,50. La probabilidad de identidad combinada con todos los marcadores fue 2,4×10-17 para individuos seleccionados aleatoriamente y 2,6×10-7 para hermanos completos. Las probabilidades de exclusión combinada fueron superiores a 0,999. Todos estos parámetros presentaron valores satisfactorios para la realización de pruebas de identidad y paternidad. Seguidamente, se realizaron pruebas de confirmación de paternidad en 137 crías con padre y/o madre reportados procedentes de 3 hatos. Los porcentajes de rechazo de paternidad basados en el principio de exclusión (al menos 2 loci discordantes) vs. índices críticos de verosimilitud, fueron respectivamente: 18,2% vs. 24,1% para las madres, 14,0% vs. 12,5% para los padres, y 34,6% vs. 26,3% para los tríos. Se observaron diferencias significativas entre hatos para el porcentaje de rechazo de paternidad, oscilando desde 15,6 a 39,4% en madres, 0 a 30% en padres, y 19,5 a 31,8% en tríos. Se demuestra la necesidad de un mayor control en los apareamientos y en el registro de información genealógica en estos hatos. |
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Evaluación de medios de cultivo in vitro para especies forestales nativas en peligro de extinción en Ecuador |
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AGROCOST321972024-08-30T15:48:14Z Evaluación de medios de cultivo in vitro para especies forestales nativas en peligro de extinción en Ecuador Pruebas de identidad y paternidad en ganado brahman registrado de Costa Rica Campos, Jorge Vargas, Bernardo Camacho, Jorge Cruz, Argerie Microsatellite exclusion probability likelihood ratio Microsatélite probabilidad de exclusión razón de verosimilitud Evaluation of in vitro culture media for native forest species in danger of extinction in Ecuador. The native species Myroxylon balsamum (balsam), Tabebuia crhysantha (guayacán) and Tabebuia billbergii (blackwood), are endemic forest species of the dry forest of the coast of Ecuador and Peru. The objectives of the research were: i) to develop a protocol for establishing, multiplying micropropagated plants in vitro conditions for the establishment of endangered native species in southern Manabi, and ii) defining the means of cultivation and disinfection protocols suitable for in vitro reproduction of threatened native species, using different concentrations of Povidyn®, NaClO + Tween + HgCl2 and exposure times for the establishment. According to the results in the in vitro establishment phase of explants of M. balsamum, T. crhysantha and T. billbergii, it was demonstrated that the application of Povidyn® for 20 minutes + 15% NaClO + 2 drops Tween for 5 minutes + 0.5% HgCl2 for 5 minutes, significantly reduces the contamination of the explants by microorganisms, reaching 90%, 87% and 88% respectively of live explants, free from contamination by fungi and bacteria at 30 days of evaluation. In the in vitro multiplication phase, the MS medium supplemented with 2 mg.l-1 BAP + 1 mg.l-1 ANA, allowed to generate 80%, 82% and 87 of healthy shoots in M. balsamum, T. crhysantha and T. billbergii respectively. The rooting of outbreaks of the three species in combined doses of BAP / AIB and BAP / ANA, had no effect. In vitro production of plant material selected from M. balsamum, T. crhysantha and T. billbergii, confirms the usefulness of micropropagation over the use of conventional techniques. En programas de evaluación genética es indispensable la correcta identificación de los individuos de la población y la certeza de sus relaciones de parentesco. El objetivo de este estudio fue implementar pruebas de identificación y verificación de paternidad mediante 18 marcadores microsatélite en ganado registrado de raza Brahman de Costa Rica. Inicialmente, se calcularon parámetros genéticos poblacionales a partir del análisis de 950 muestras de ADN (7 sementales, 788 vacas y 155 crías) colectadas durante los años 2015/2016, procedentes de 13 hatos de ganado registrado. Los promedios de heterocigosidad observada y esperada fueron de 0,67 y 0,70, respectivamente. El índice de fijación fue de 4%, con desviaciones significativas del equilibrio Hardy-Weinberg (EHW) en 9 de los 18 loci. Todos los marcadores, excepto ETH225, presentaron contenido de información polimórfica mayor a 0,50. La probabilidad de identidad combinada con todos los marcadores fue 2,4×10-17 para individuos seleccionados aleatoriamente y 2,6×10-7 para hermanos completos. Las probabilidades de exclusión combinada fueron superiores a 0,999. Todos estos parámetros presentaron valores satisfactorios para la realización de pruebas de identidad y paternidad. Seguidamente, se realizaron pruebas de confirmación de paternidad en 137 crías con padre y/o madre reportados procedentes de 3 hatos. Los porcentajes de rechazo de paternidad basados en el principio de exclusión (al menos 2 loci discordantes) vs. índices críticos de verosimilitud, fueron respectivamente: 18,2% vs. 24,1% para las madres, 14,0% vs. 12,5% para los padres, y 34,6% vs. 26,3% para los tríos. Se observaron diferencias significativas entre hatos para el porcentaje de rechazo de paternidad, oscilando desde 15,6 a 39,4% en madres, 0 a 30% en padres, y 19,5 a 31,8% en tríos. Se demuestra la necesidad de un mayor control en los apareamientos y en el registro de información genealógica en estos hatos. Universidad de Costa Rica 2018-01-29 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion Article Artículo application/pdf application/xml https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/agrocost/article/view/32197 10.15517/rac.v42i1.32197 Agronomía Costarricense; Agronomía Costarricense: Vol. 42, Issue 1 (January-June) Agronomía Costarricense; Agronomía Costarricense: Vol. 42, Nº 1 (Enero-Junio) 2215-2202 0377-9424 10.15517/rac.v42i1 spa https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/agrocost/article/view/32197/31857 https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/agrocost/article/view/32197/32602 Derechos de autor 2018 Agronomía Costarricense https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0 |