Connectivity of the sea urchin Diadema mexicanum A. Agassiz, 1863 (Echinoidea, Diadematidae) in the Pacific coast of Costa Rica
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| Formato: | Online |
| Idioma: | eng spa |
| Publicado: |
Universidad Nacional, Costa Rica.
2025
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| Acceso en línea: | https://www.revistas.una.ac.cr/index.php/revmar/article/view/20489 |
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REVMAR20489 |
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Universidad Nacional de Costa Rica |
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Revista Ciencias Marinas y Costeras |
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Online |
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Carvajal-Rojas, Sofía Brenes-Guillén, Laura González-Sánchez, Kaylen Cordón-Krumme, María Isabel Montiel-Barrantes, María Paula Alvarado, Juan Jose Alvarado, Juan Jose |
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Carvajal-Rojas, Sofía Brenes-Guillén, Laura González-Sánchez, Kaylen Cordón-Krumme, María Isabel Montiel-Barrantes, María Paula Alvarado, Juan Jose Alvarado, Juan Jose Connectivity of the sea urchin Diadema mexicanum A. Agassiz, 1863 (Echinoidea, Diadematidae) in the Pacific coast of Costa Rica |
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Conectividad de la población del erizo de mar Diadema mexicanum A. Agassiz, 1863 (Echinoidea, Diadematidae) en el Pacífico de Costa Rica Conectividade populacional do ouriço-do-mar Diadema mexicanum A. Agassiz, 1863 (Echinoidea, Diadematidae) no Pacífico da Costa Rica |
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REVMAR204892025-04-28T18:57:04Z Connectivity of the sea urchin Diadema mexicanum A. Agassiz, 1863 (Echinoidea, Diadematidae) in the Pacific coast of Costa Rica Conectividad de la población del erizo de mar Diadema mexicanum A. Agassiz, 1863 (Echinoidea, Diadematidae) en el Pacífico de Costa Rica Conectividade populacional do ouriço-do-mar Diadema mexicanum A. Agassiz, 1863 (Echinoidea, Diadematidae) no Pacífico da Costa Rica Carvajal-Rojas, Sofía Brenes-Guillén, Laura González-Sánchez, Kaylen Cordón-Krumme, María Isabel Montiel-Barrantes, María Paula Alvarado, Juan Jose Alvarado, Juan Jose echinoid gene flow genetic markers microsatellites population genetics echinoidea flujo génico genética de poblaciones marcadores genéticos microsatélites echinoidea fluxo gênico genética populacional marcadores genéticos microssatélites Diadema mexicanum is essential for controlling algae and maintaining coral dominance on coral reefs. Despite its importance as a key grazing species, little is known about the genetic structure and connectivity of its populations. Molecular markers are particularly sensitive to genetic differences between disjunct populations, providing insight into their resilience to environmental changes. This study seeks to genetically characterize D. mexicanum populations on coral reefs along the Pacific coast of Costa Rica. Sampling took place between May and October 2019. DNA was extracted from each sample, and microsatellite markers were subsequently amplified using primers designed for D. antillarum and Strongylocentrotus nudus. Data analysis was performed using GeneMarker, R Studio, and Structure. The analysis revealed lower genetic diversity than previously reported for these microsatellites, resulting in high inbreeding coefficient values. This could be attributed to several factors, such as high reproductive success variation and null alleles. A weak genetic structure was found among sampling sites, but this structure was independent of the region where samples were collected. No isolation by distance was detected, suggesting genetic connectivity and gene flow within populations. Future studies would benefit from analyzing a wider range of molecular markers and ensuring more equitable sampling across sites. Diadema mexicanum es esencial para el control de algas y el mantenimiento del dominio coralino en los arrecifes de coral. A pesar de su importancia como especie clave de pastoreo, se conoce poco sobre la estructura genética y la conectividad de sus poblaciones. Los marcadores moleculares son particularmente sensibles a las diferencias genéticas entre poblaciones disjuntas, lo que proporciona información sobre su resiliencia frente a los cambios ambientales. Este estudio busca caracterizar genéticamente las poblaciones de D. mexicanum en arrecifes de coral a lo largo del Pacífico de Costa Rica. El muestreo se realizó entre mayo y octubre de 2019. Se extrajo ADN de cada muestra y, posteriormente, se amplificaron los marcadores microsatélites utilizando cebadores diseñados para D. antillarum y Strongylocentrotus nudus. El análisis de datos se realizó con GeneMarker, R Studio y Structure. El estudio reveló una diversidad genética menor que la reportada previamente para estos microsatélites, lo que resulta en altos valores de coeficiente de endogamia. Esto podría atribuirse a varios factores, incluyendo la alta variación en el éxito reproductivo y la presencia de alelos nulos. Se encontró una estructura genética débil entre los sitios de muestreo, pero esta estructura era independiente de la región donde se recolectaron las muestras. No se detectó aislamiento por distancia, lo que sugiere conectividad genética y un flujo génico dentro de las poblaciones. Estudios futuros se beneficiarían del análisis de una gama más amplia de marcadores moleculares y de asegurar un muestreo más equitativo entre los sitios. A Diadema mexicanum é essencial para o controle de algas e a manutenção da dominância de corais em recifes de corais. Apesar de sua importância como uma das principais espécies de pastagem, pouco se sabe sobre a estrutura genética e a conectividade de suas populações. Os marcadores moleculares são particularmente sensíveis às diferenças genéticas entre populações disjuntas, fornecendo informações sobre sua resistência às mudanças ambientais. Este estudo tem como objetivo caracterizar geneticamente as populações de D. mexicanum em recifes de coral ao longo da costa do Pacífico da Costa Rica. A amostragem foi realizada entre maio e outubro de 2019. O DNA foi extraído de cada amostra e, em seguida, os marcadores microssatélites foram amplificados usando primers projetados para D. antillarum e Strongylocentrotus nudus. A análise de dados foi realizada com GeneMarker, R Studio e Structure. O estudo revelou uma diversidade genética menor do que a relatada anteriormente para esses microssatélites, resultando em altos valores de coeficiente de endogamia. Isso pode ser atribuído a vários fatores, incluindo a alta variação no sucesso reprodutivo e a presença de alelos nulos. Foi encontrada uma estrutura genética fraca entre os locais de amostragem, mas essa estrutura era independente da região onde as amostras foram coletadas. Não foi detectado isolamento por distância, o que sugere conectividade genética e fluxo gênico entre as populações. Estudos futuros se beneficiariam da análise de uma gama mais ampla de marcadores moleculares e da garantia de uma amostragem mais equitativa entre os locais. Universidad Nacional, Costa Rica. 2025-04-23 info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion Peer-reviewed article Artículo evaluado por pares Artigo revisto por pares application/pdf text/html application/epub+zip audio/mpeg audio/mpeg https://www.revistas.una.ac.cr/index.php/revmar/article/view/20489 10.15359/revmar.17-1.5 Revista Ciencias Marinas y Costeras; Vol. 17, Num. 1 (2025): (January-June); 91-115 Revista Ciencias Marinas y Costeras; Vol. 17, Num. 1 (2025): (enero-junio); 91-115 Revista Ciencias Marinas y Costeras; Vol. 17, Num. 1 (2025): (enero-junio); 91-115 1659-407X 1659-455X eng spa https://www.revistas.una.ac.cr/index.php/revmar/article/view/20489/33232 https://www.revistas.una.ac.cr/index.php/revmar/article/view/20489/33233 https://www.revistas.una.ac.cr/index.php/revmar/article/view/20489/33234 https://www.revistas.una.ac.cr/index.php/revmar/article/view/20489/33235 https://www.revistas.una.ac.cr/index.php/revmar/article/view/20489/33236 Copyright (c) 2025 María Paula Montiel-Barrantes, Laura Brenes-Guillén, Sofía Carvajal-Rojas, Kaylen González-Sánchez, María Isabel Cordón-Krumme, Juan Jose Alvarado http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0 |